de novoアセンブリ
容易なde novoアセンブリ

Chromium de novoアセンブリソリューション
Supernovaアセンブラによる真の二倍体アセンブリ
Supernovaアセンブラで真のゲノムを発見し、低コストで容易な二倍体アセンブリ解析へ。サンプル固有の配列を見つけ出し、二倍体のゲノム構造を解き明かし、リファレンス配列を必要としない解析を可能に。
10xソリューションの特長
- 他手法とは異なる真の二倍体アセンブリ
- 迅速でシンプルなde novoアセンブリワークフロー
- サンプルからアセンブリまでに必要な時間はたった2週間
- 10 Mbサイズのスキャフォルドおよび広範囲における精度
- わずか1 ngのDNAから高品質なアセンブリ
- ヒトゲノムに関して検証およびサポート*

*ヒト以外のサンプルに関する注意:Supernovaは生殖細胞系のヒトゲノムのアセンブリのために設計されたde novoアセンブリプログラムで、Chromium Genome Reagent Kitから得られたデータを使用します。10x Genomicsでは、Chromium Genome Reagent KitおよびSupernovaの検証をヒトゲノムに関してのみ実施しています。したがって、ヒト以外のゲノムアセンブリへのSupernovaの使用は試験的であり、予想外の特性によりアセンブリの品質が制限される可能性があります。しかし実際には、多くのユーザーがSupernovaを用いたヒト以外のゲノムのアセンブリに成功しています。

Chromium Controller
コンパクトで洗練された機能的なデザイン
コンパクトで洗練されたChromium Controllerは、サンプルのパーティション化および分子バーコード化の高度な同時進行を可能にします。数10万回~数100万回に相当するピペット操作を、迅速かつ効率的に自動化できるように設計されています。Chromium Controllerは、ゲノムからシングルセルの解析まで、すべてのChromiumソリューションにお使いいただけます。
Chromium Controllerの詳細製品情報
Chromium de novo アセンブリソリューション
Chromium Controller装置パーツ番号 120223および120246、あるいはChromium Single Cell Controller装置パーツ番号120263および120212にのみ利用可能です。
試薬および消耗品
反応
製品コード
Chromium Genome Chip Kit v2
48 rxns
120257
Chromium Genome HT Library & Gel Bead Kit v2
96 rxns
120261
Chromium Genome Library Kit & Gel Bead Kit v2
16 rxns
120258
Chromium i7 Multiplex Kit
96 rxns
120262
ソフトウェア
The Supernova Assembler

ソフトウェア
ポスター
Full spectrum genome analysis with Linked-Read sequencing
- PAGSan Diego, CA2018
How to determine the genome sequence of single insects
- PAGSan Diego, CA2018
Assembly of individual chromosomes at megabase scale using 10x Linked-Reads
- Genome InformaticsCold Spring Harbor Laboratory, New YorkNovember 1 – November 4, 2017