容易なde novoアセンブリ

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Chromium de novoアセンブリソリューション

Supernovaアセンブラによる真の二倍体アセンブリ

Supernovaアセンブラで真のゲノムを発見し、低コストで容易な二倍体アセンブリ解析へ。サンプル固有の配列を見つけ出し、二倍体のゲノム構造を解き明かし、リファレンス配列を必要としない解析を可能に。

10xソリューションの特長

  • 他手法とは異なる真の二倍体アセンブリ
  • 迅速でシンプルなde novoアセンブリワークフロー
  • サンプルからアセンブリまでに必要な時間はたった2週間
  • 10 Mbサイズのスキャフォルドおよび広範囲における精度
  • わずか1 ngのDNAから高品質なアセンブリ
  • ヒトゲノムに関して検証およびサポート*
ワークフローはこちらから
Genome Solution Suite


*ヒト以外のサンプルに関する注意:Supernovaは生殖細胞系のヒトゲノムのアセンブリのために設計されたde novoアセンブリプログラムで、Chromium Genome Reagent Kitから得られたデータを使用します。10x Genomicsでは、Chromium Genome Reagent KitおよびSupernovaの検証をヒトゲノムに関してのみ実施しています。したがって、ヒト以外のゲノムアセンブリへのSupernovaの使用は試験的であり、予想外の特性によりアセンブリの品質が制限される可能性があります。しかし実際には、多くのユーザーがSupernovaを用いたヒト以外のゲノムのアセンブリに成功しています。

Assembly Controller

Chromium Controller

コンパクトで洗練された機能的なデザイン

コンパクトで洗練されたChromium Controllerは、サンプルのパーティション化および分子バーコード化の高度な同時進行を可能にします。数10万回~数100万回に相当するピペット操作を、迅速かつ効率的に自動化できるように設計されています。Chromium Controllerは、ゲノムからシングルセルの解析まで、すべてのChromiumソリューションにお使いいただけます。

Chromium Controllerの詳細

製品情報

Chromium de novo アセンブリソリューション

試薬および消耗品

反応
製品コード
Chromium Genome Chip Kit v2
48 rxns
120257
Chromium Genome HT Library & Gel Bead Kit v2
96 rxns
120261
Chromium Genome Library Kit & Gel Bead Kit v2
16 rxns
120258
Chromium i7 Multiplex Kit
96 rxns
120262

システム

保証
製品コード
Chromium Controller & Next GEM Accessory Kit
120223
120246

ソフトウェア

The Supernova Assembler
アセンブリデータセット
学術セミナー

Dissecting Complex Systems with Multidimensional Data

 
  • Sarah Garcia
10x Genomics, Inc.
March 21, 2019

Genome Assembly of the Mind-controlling Fly Pathogen E. Muscae Via 10x Genomics

 
  • Carolyn Elya
University of California, Berkeley
March 21, 2017
User Group Meeting – San Francisco, CA

de Novo Assembly of a Large Size Genome: the Olive Fruit Fly

 
  • Jiannis Ragoussis
McGill University
February 14, 2017
AGBT Annual Meeting – Hollywood, FL
ポスター

Assembly of individual chromosomes at megabase scale using 10x Linked-Reads

  • Genome Informatics
    Cold Spring Harbor Laboratory, New York
    November 1 – November 4, 2017

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