Gulf Coast Single Cell Bioinformatics Bootcamp Session 2 02052025

Chromium シングルセル遺伝子発現は、数百から数万個の細胞からのシングルセルトランスクリプトーム3'遺伝子発現プロファイルとマルチオミクスの可能性を提供します。遺伝子解析、細胞表面タンパク質発現、細胞ごとのCRISPR修飾などによって、細胞の不均一性を探り、新規ターゲットやバイオマーカーの発見に挑みます。

細胞表面タンパク質

Protein co-detection

Gene Expression

Immune Profiling

CRISPRスクリーニング

サンプルマルチプレックス

複雑な細胞多様性を細胞レベルで解き明かす

Chromium X シリーズ

Chromium

Advanced system for multiomic analysis of hundreds to millions of cells.

シングルセル遺伝子発現解析

Epigenomic Profiling

従来の遺伝子発現解析を超えて、細胞集団、細胞タイプ、細胞状態などの特性を明らかにしましょう

Loupe Browserは、10x Genomics データの探索に必要な解析機能を提供する強力かつ直感的な視覚化ソフトウェアです。WindowsとMacOSの両方に対応した使いやすいデスクトップアプリケーションで、データから生物学的な解釈を引き出すことができます。

データから生物学的解釈まで

Loupe Browser

Visium

Chromiumシングルセル免疫プロファイリングは、免疫学の課題に対しマルチオミックスのソリューションを提供します。B細胞またはT細胞受容体のペア配列、表面タンパク質発現、抗原特異性、遺伝子発現を1つの細胞から解析することができます。

抗原特異性

免疫多様性を細胞ごとにマルチオミックスプロファイリング

シングルセル免疫プロファイリング

B細胞やT細胞受容体の完全長ペア配列、表面タンパク質の発現、抗原特異性、遺伝子発現などを、シングルセルから解析

ChromiumシングルセルATAC（Assay for Transposase Accessible Chromatin）は、シングルセルレベルでのクロマチンアクセシビリティ解析を可能にし、細胞の種類や状態の知見、遺伝子制御機構の理解をさらに深めます。

エピゲノムの全体像を細胞レベルで解析

シングルセルATAC

クロマチンのアクセス性をシングルセルレベルで解析

ChromiumシングルセルマルチオームATAC + 遺伝子発現は、同一細胞における遺伝子発現とオープンクロマチン領域を同時にプロファイリングします。細胞の種類や状態の特徴を理解し、遺伝子制御のプログラムを明らかにする力を倍増させます。

トランスクリプトームとエピゲノムをすべての細胞で統合

Chromium Controller

Compact system for multiomic analysis of hundreds to tens of thousands of single cells.

シングルセルマルチオームATAC + 遺伝子発現

同一細胞からの遺伝子発現とオープンクロマチンを同時にプロファイリング

ターゲット遺伝子発現を使用すれば、シングルセルや組織切片から興味のある転写産物セットをプロファイリングできます。カスタム化できる包括的な遺伝子パネルを利用することで、サンプル数を増やしつつコストを削減したり、シーケンスの深さを増やすことができます。

Discontinuation of Targeted Gene Expression

Chromium Connect

Automated system for single cell partitioning, barcoding, and library preparation.

ターゲット遺伝子発現

シングルセルまたは組織切片から、選ばれた転写産物のセットのみをプロファイリング

Visium空間的遺伝子発現は、全mRNAに基づいて組織を分類できる次世代の分子技術です。FFPEまたは新鮮凍結組織における形態学的な情報（context）とトランスクリプトーム全体をマッピングすることにより、正常な発生学、疾患病理学、および臨床トランスレーショナルリサーチへの新たな知見を見出すことができます。

免疫蛍光タンパク質の同時検出

Visium CytAssist遺伝子およびタンパク質発現解析

組織環境を保ちつつ全トランスクリプトームをマッピング

Visium CytAssist

標準的なガラススライドからVisiumスライドへのトランスクリプトームプローブの移動を容易にすることで、Visiumワークフローを簡素化するために設計されたコンパクトな装置です。

空間的遺伝子発現

インタクトな組織切片での空間的な遺伝子発現を測定

Explore 10x Genomics data with our powerful visualization software. Compatible with single cell and spatial products.

Analyze single cell gene expression data with a set of free, easy-to-use analysis pipelines.

Bioinformatics Bootcamp Session 2: Hands-on single cell gene expression data analysis