次世代のシングルセル解析が登場
新たなGEM-Xテクノロジーを利用したChromium、シングルセル遺伝子発現v4およびChromiumシングルセル免疫プロファイリングv3
新たな知見
細胞の多様性、希少細胞、疾患関連細胞種を発見します。
シングルセル免疫プロファイリングはがんサンプルにおけるバイオマーカーの発見を促進します
コロンビア大学およびMDアンダーソンの研究者らが行った、がん研究に影響力のある洞察をもたらした3つの独立した研究をご紹介します。
シングルセルマルチオミクスは赤血球産生の主要な調節因子であるエリスロポエチンの裏にある腎細胞を明らかにしました
シングルセル遺伝子発現とエピゲノム解析を利用して、エリスロポエチン産生の背後にある細胞種を突きとめ、貧血治療の可能性を広げた論文が、最近のNature Medicine誌に掲載されました。
クリーンベンチ内に創薬と開発をもたらすオルガノイド
肝疾患における創薬対象となりうる経路、腎疾患治療薬のスクリーニング、肝臓における薬物代謝のモデル化、がん患者由来モデルにおける治療反応の研究、というシングルセルRNA-seqおよびオルガノイドを用いた4つの研究チームの研究をご紹介します。
新鮮サンプル、凍結サンプル、FFPEサンプルに適用可能なプローブベースの遺伝子発現
10x Genomicsの最高感度を誇る全トランスクリプトーム解析は、ご希望のスケジュールどおりにサンプルの固定化、バッチ化、測定を実行できる柔軟性を備えています。
免疫レパトアプロファイリングに対応した5' 遺伝子発現
BCRまたはTCRのレパトアプロファイリングなど、免疫多様性を包括的に解析できるマルチオミクス機能とオプションを備えたアッセイです。
CRISPRガイドRNAとそれによって変動した表現型を直接リンクします
タンパク質と遺伝子の発現を同時に捕捉し、複雑な生物学の特徴をさらに明らかにします
迅速な抗原特異的クロノタイプ同定により、治療法の発見を加速します
箱から出すだけ
10x Genomicsのユーザーフレンドリーな装置が、パイロット研究から百万細胞レベルの実験まで、あらゆる研究に再現性と効率性をお届けします。アッセイシリーズ全体をサポートします。
直感的な解析法を搭載
アッセイをご購入いただくと、10x Genomicsの一連のソフトウェアツールが付属しているため、バイオインフォマティクスの経験がなくてもデータの処理と視覚化が可能です。
生のシーケンスデータを細胞特性マトリックスに変換するまずはCell Rangerから始めましょう。Chromiumシングルセルデータのための解析パイプラインであり、リードのアライメントとデータ処理を行います。
10x Genomicsの高速クラウドインフラストラクチャーにより短時間で結果を得るCloud Analysisでは、ウェブブラウザからCell Rangerのパイプラインにすばやく簡単にアクセスできます。
クラスターを調査し、発現パターンを調べるLoupe Browserでは、Cell Rangerでの結果をインタラクティブに探索することができます。遺伝子発現パターンの検討や細胞種への注釈付け、図の作成などが可能です。
関連資料
シングルセルのデータにアクセスサンプル種別、生物種、疾患の状態、保存方法などでフィルタリング可能です。
査読付き論文を閲覧する他の研究者がどのようにChromiumを利用して影響力ある科学研究を進めているかをご紹介します。
技術文書を調べるFAQ、ハウツー動画、ユーザーガイドなどから必要な答えを探し出しましょう。
Visiumを使用してシングルセルプロファイルを組織コンテキスト内にマッピングすることで、得られた知見をさらに広めることができます。また、Xeniumを用いることで細胞下レベルの精度で特定の標的に関する理解を深めることができます。
Visium 空間解析FFPEまたは新鮮凍結組織切片の空間的遺伝子発現を評価します。細胞の機能と位置の関係を明確にしながら、全トランスクリプトームに関する発見を活用します。
Xenium In Situ単一分子内の数百のRNA標的について、組織切片内の位置を細胞下の解像度で特定します。シングルセル解析および空間解析で得られた生物学的知見をより精密なものとし、検証を行えます。