成功のためのシングルセルイノベーションとワークフロー
ワークフローのどのステップでも自信を持ってシングルセル解析
あらゆるシングルセルの可能性を考慮して最適化されたサンプル調製
多様なサンプルに対応
逆転写（RT）をベースとしたユニバーサルアッセイで、広範な生物種からデータを収集
プローブをベースとしたFlexアッセイでFFPEサンプル使用時でも研究の規模を拡大
キット化された試薬と統一されたワークフローで凍結サンプルからも簡単に核を単離
拡張可能で柔軟なスループット
1ランの処理量が1～128サンプル、細胞数にして数百～数百万のプロファイリングができる柔軟性により、パイロット研究から大規模な実験までスケールアップ
頑健な固定化プロトコール（全血サンプルにも対応）を利用し、スケジュールに合わせたアッセイのバッチ化・ランが可能
マルチプレックスオプションで効率を向上
ユニバーサル 3’および5’アッセイ用のオンチップでのマルチプレックス化で試薬量とコストを削減
固定化サンプルについてインライン方式のマルチプレックス化で、ランあたり最大250万細胞のプロファイリングとサンプルのバッチ処理が可能
自動での細胞分画化とバーコード付加
GEM：Chromiumシングルセルテクノロジーの中核
Chromium Xシリーズ装置 の中で、細胞は限界希釈された状態で流路を移動し、6分で10,000個以上のナノメートルサイズのゲルビーズインエマルジョン（GEM）を生じます。 この各GEMがマイクロ反応の場となります。ゲルビーズは溶解され、各細胞に由来する標的分子がキャプチャーおよびバーコード付加されて、その分子が由来する細胞のマークが付けられます。
Chromium装置の利点
ご存じでしたか？Chromium Xシリーズ装置は、シングルセルアッセイの最重要ステップである細胞分画化とバーコード付加を自動化しています。 この迅速で効率的なワークフローは、労働集約的で時間のかかる手動ワークフローによく見られる技術的なエラーとバッチエフェクトを減らします。さらに、この装置を進化したGEM-Xと組み合わせることで、業界トップクラスの最大80%という細胞回収率と優れた再現性を実現します。
MiSeq
NextSeq 500/550/2000
HiSeq 2500 (Rapid Run)
HiSeq 3000/4000
NovaSeq 6000
データを探索し、発見する ― データを探索し発見するのにバイオインフォマティクスの経験は不要
標準scRNA-Seqデータ処理を含む使いやすいパイプラインCell Rangerで下流解析を実施
最適化されたクラウドインフラ上のコストがかからない10x Genomics Cloud AnalysisでCell Rangerをランして迅速に結果を獲得
直感的なLope Browserで処理データを視覚化し、興味のある遺伝子の異なる遺伝子発現をプロット化
自動細胞アノテーションなど継続的なイノベーションによる新機能を利用
汎用性の高いケミストリーで様々なインプット、アプリケーション、スケールをサポート
プローブベースアッセイ
ヒトまたはマウスの18,000以上のコーディング遺伝子を対象としたプローブセットを使用し、新鮮、凍結、固定サンプルのタンパク質に関する測定値と組み合わせます。
なぜプローブベースのFlexアッセイを選択？
3倍のターゲットカバレッジで、FFPEサンプルや低品質サンプルであっても高い感度と優れた性能を利用できます
同一のチップで250万細胞ものランが可能である最高水準のスループットを活かし、大規模実験を1細胞あたりわずか数円で実行します
逆転写（RT）ベースのアッセイ
全トランスクリプトームを捕捉して、マルチオミックスのオプション（タンパク質、CRISPR、BCR/TCR、オープンクロマチン）と組み合わせます。
なぜRTベースのユニバーサル 3’または5’アッセイを選択？
様々な生物種から幅広い情報（アイソフォーム、一塩基多型、長鎖ノンコーディングRNAなど）を収集します
コスト効率の高い研究を実施し、試薬の使用効率を向上させ、1サンプルあたり10万円台のコストで小規模なスケールでも実行できます
柔軟なスケーリングと高い効率を備えた、合理的なマルチプレックス化機能
Flexプローブベースアッセイのインラインマルチプレックス化とバッチ化
なぜFlexのマルチプレックス化を選択？
GEM生成の前に細胞混濁液の固定とハイブリダイズすることで流路あたり16サンプルをプール
バッチ化とマルチプレックス化により、1～128サンプル、1ランあたり最大250万細胞の処理が可能となり、最大規模の研究に対応できます
実験のワークフローを便利にして、意欲的なプロジェクトや多施設での共同試験を合理化します
ユニバーサル 3’ & 5’ RTベースアッセイのオンチップマルチプレックス化
なぜユニバーサルアッセイのオンチップマルチプレックス化を選択？
4つのサンプルから同時に細胞の分画化を行い、すべてのGEMを同一の回収ウェルに集めてから、シーケンス後にコンピュータ上でサンプルのデマルチプレックス化を実行します。
小規模の研究でもオンチップマルチプレックスで1〜8サンプルを処理してチップあたり最大4万細胞を産出
チップローディングの上流でサンプルにタグ付けすることなく、マルチプレックス化を簡単にワークフローに組み込めます
生物学の全領域を解き明かす
| プラットフォーム | |||
| どんなときに | 包括的なシングルセルデータ細胞の集団および状態に関する詳細な解析に最適 | 高解像度の空間的遺伝子発現複雑な組織、近傍領域、細胞間相互作用を理解し、他の空間的オミックス、組織、形態に関する情報と統合 | |
| 何のために | 偏りのないシングルセルの発見
高い遺伝子感度 | 偏りのない空間的な発見 | ターゲット空間的探索
高い遺伝子感度 |
| アプリケーション | 全トランスクリプトーム遺伝子発現
タンパク質
TCR, BCR
CRISPR
ATAC | 全トランスクリプトーム遺伝子発現 | ターゲット遺伝子発現（最大5,000遺伝子） |
| 解像度 | シングルセル | 2 μm四方に割り当てられた転写物 | シングルセル |
| データの測定 | NGSベース | NGSベース | 画像ベース |
| 対応サンプル | シングルセルまたは核の懸濁液（新鮮組織、凍結組織、またはFFPEサンプルから） | FFPE
Fresh frozen
Fixed frozen | 新鮮凍結組織
FFPE |
