这是Xenium原位分析数据的预览版，来自Xenium分析仪的开发版本。
您也可以访问www.10xgenomics.com/datasets，查看来自改进后的Xenium分析仪生产版本的新数据。
关键指标
- 物种和组织人类乳腺
- 保存方法FFPE
- 使用的现成的基因组合Xenium人类乳腺基因表达Panel（280个基因）
- 定制基因的数量33
- 组织面积0.4 cm²
- 检测的细胞数*167,780
- 检测到的转录本总数*34,442,716
- 每个细胞的转录本中值*166
利用Xenium探索细胞类型异质性，并通过同一切片的H&E染色来验证。
细胞类型和基因特征的空间分布可揭示不同的组织宏观结构，并捕获肿瘤区域内大量的细胞和分子异质性。
Xenium鉴定出人类乳腺中的主要细胞类型。正如两个例子所示，在研究肿瘤亚型异质性和肿瘤上皮细胞周围的微环境时，空间信息是必不可少的。Xenium分析后获得的H&E染色结果有助于解释和验证丰富的转录本信息。
基于DAPI的细胞分割
Xenium使用一种内部训练的模型，根据DAPI图像进行细胞核分割。Xenium分析软件能够对不规则形状的细胞核进行良好分割。转录本是根据细胞核的膨大来分配的。
Xenium的输出结果可以通过常用的单细胞数据分析软件来分析，以注释细胞簇或鉴定差异表达基因。
寻找稀有的三阳性细胞
在被归为ERBB2（HER2）阳性、ESR1（ER）阳性和PGR（PR）阳性的乳腺肿瘤中，Xenium发现了稀有的三阳性细胞，它们同时表达三种激素受体。
