Visium空间分析

在组织背景下探索全转录组

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Visium breast cancer sample data

现已发售

通过Visium HD空间基因表达迈入空间发现的新时代

  • 以单细胞级别的分辨率开展全转录组分析
  • 连续的组织覆盖
  • 基于探针的创新化学方法和Visium CytAssist支持的工作流程带来了优异的数据
清晰地观察组织

Insights from spatial profiling in action

See how whole transcriptome spatial analysis has helped researchers identify cell types and cell–cell interactions that drive crucial functions in health and disease.

分析

灵活的分析,可满足您的需求

分析方案

Visium HD空间基因表达

Visium HD空间基因表达
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Spatial Gene Expression v2 & v1

Spatial Gene Expression v2 & v1

空间基因和蛋白表达

空间基因和蛋白表达

您可以做什么

经过验证的单细胞分辨率和连续覆盖整个组织的全转录组空间分析。

  • Whole transcriptome

同时分析FFPE和冷冻组织切片的分子和成像数据。

  • Whole transcriptome

利用基于探针的化学方法和标记抗体,同时分析FFPE组织的RNA和蛋白表达。

  • Whole transcriptome
  • Protein expression

物种兼容性

人和小鼠

FFPE样本

新鲜冷冻样本

固定冷冻样本

FFPE样本

组织兼容性

FFPE样本

FFPE样本

新鲜冷冻样本

固定冷冻样本

FFPE样本

捕获区域大小

6.5 mm x 6.5 mm

6.5 mm x 6.5 mm

11 mm x 11 mm

6.5 mm x 6.5 mm

11 mm x 11 mm

分析物捕获方法

  • 使用CytAssist,基于探针的化学方法(适用于FFPE)
  • CytAssist enabled, probe-based chemistry (for FFPE, fresh frozen, and fixed frozen)
  • Direct Placement, Probe-based chemistry (for FFPE)
  • 使用CytAssist,基于探针的化学方法(适用于FFPE)
  • Visium CytAssist仪器

    简化的样本处理,强大的空间见解

      1
    1. 从标准载玻片上的经典组织学流程开始
    2. 2
    3. 利用仪器将载玻片上的转录本/蛋白信息转移至Visium捕获区域
    4. 3
    5. 继续完成Visium工作流程中的其余步骤
    查看仪器详情
    观看工作原理
  • Visium CytAssist instrument
  • 空间分析

    直观的软件协助您开展空间分析

    处理空间基因表达数据

    Space Ranger是一套完整的分析流程,可处理Visium空间基因表达数据及明场和荧光显微镜图像,帮助您在组织切片上绘制全转录组数据。

    查看细胞簇和表达模式

    在Space Ranger运行结束后,您可以使用交互式的Loupe Browser桌面软件查看结果。Loupe Browser是一款桌面应用程序,可与Space Ranger分析流程无缝整合,帮助您轻松浏览叠加在原始组织切片图像上的分子表达模式。

    资源和文档

    探索空间生物学的力量

    通过互补平台加强空间发现

    您可以对新发现的细胞类型开展单细胞图谱分析,也可以利用Xenium的亚细胞精度加深您对特定靶点的了解,从而扩展Visium分析的见解。

    • 10x Genomics Chromium Single Cell Platform

      对多达100万个单细胞开展转录组分析,兼具多组学分析功能

      表征组织异质性,发现稀有细胞类型,并逐个细胞解析分子机制。

    • image

      靶向分析组织样本中单个细胞内的成百上千个RNA

      以亚细胞分辨率定位基因表达,有多种经过验证且生物学相关的基因组合可供选择。

    开启您的Visium之旅

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