Visium空间分析

在组织背景下探索全转录组

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Visium breast cancer sample data

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通过Visium HD空间基因表达迈入空间发现的新时代

  • 以单细胞级别的分辨率开展全转录组分析
  • 连续的组织覆盖
  • 基于探针的创新化学方法和Visium CytAssist支持的工作流程带来了优异的数据
清晰地观察组织
Visium空间分析平台

探索基因表达的空间排布

Visium平台能够对冷冻和固定的组织切片进行无偏的分子图谱分析,实现简化的组织处理和灵敏的基因检测,并通过用户友好的软件进行基因表达可视化。

Visium hardware
Visium workflow
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看看Visium如何增强您的研究能力

  • 在最大11 x 11 mm的捕获区域内分析整张切片
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    在整张组织切片上开展发现和验证研究,无需预先选择感兴趣的区域。

  • 集RNA + 蛋白 + 组织学分析于一体
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    超越基因表达分析,将转录组学与组织学和蛋白表达分析相结合,更深度地分析细胞关系。

  • 分析新鲜冷冻组织、PFA固定冷冻组织、FFPE组织及组织芯片
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    优化的工作流程适用于各种样本,且与不同物种的多个器官的兼容性已得到证明。

分析

灵活的分析,可满足您的需求

分析方案

Visium HD空间基因表达

Visium HD空间基因表达
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空间基因表达

空间基因表达

空间基因和蛋白表达

空间基因和蛋白表达

您可以做什么

经过验证的单细胞分辨率和连续覆盖整个组织的全转录组空间分析。

  • Whole transcriptome

同时分析FFPE和冷冻组织切片的分子和成像数据。

  • Whole transcriptome

利用基于探针的化学方法和标记抗体,同时分析FFPE组织的RNA和蛋白表达。

  • Whole transcriptome
  • Protein expression

物种兼容性

人和小鼠

FFPE样本

新鲜冷冻样本

固定冷冻样本

FFPE样本

组织兼容性

FFPE样本

FFPE样本

新鲜冷冻样本

固定冷冻样本

FFPE样本

分析物捕获方法

  • CytAssist enabled, probe-based chemistry (for FFPE)
  • CytAssist enabled, probe-based chemistry (for FFPE and fresh frozen)
  • Direct Placement, Probe-based chemistry (for FFPE and fixed frozen)
  • Direct Placement, Poly-A based chemistry (for fresh frozen)
  • CytAssist enabled, probe-based chemistry (for FFPE)
  • Visium CytAssist仪器

    简化的样本处理,强大的空间见解

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    1. 从标准载玻片上的经典组织学流程开始
    2. 2
    3. 利用仪器将载玻片上的转录本/蛋白信息转移至Visium捕获区域
    4. 3
    5. 继续完成Visium工作流程中的其余步骤
    查看仪器详情
  • Visium CytAssist instrument
  • 空间分析

    直观的软件协助您开展空间分析

    处理空间基因表达数据

    Space Ranger是一套完整的分析流程,可处理Visium空间基因表达数据及明场和荧光显微镜图像,帮助您在组织切片上绘制全转录组数据。

    查看细胞簇和表达模式

    在Space Ranger运行结束后,您可以使用交互式的Loupe Browser桌面软件查看结果。Loupe Browser是一款桌面应用程序,可与Space Ranger分析流程无缝整合,帮助您轻松浏览叠加在原始组织切片图像上的分子表达模式。

    在组织背景下观察任何基因

    空间捕获技术生成的数据可帮助您选择任何感兴趣的基因,并在原始组织切片上显示其空间分辨率的表达。

    • 分析人类或小鼠组织中的重要细胞类型和状态,并添加多达100个定制基因
    • 10x Genomics已在健康和病变组织上进行了广泛测试
    • 可立即发货
    资源和文档

    探索空间生物学的力量

    互补平台加强您的空间探索能力

    您可以对新发现的细胞类型开展单细胞图谱分析,也可以利用Xenium的亚细胞精度加深您对特定靶点的了解,从而扩展Visium分析的见解。您可以在单细胞多组学、空间或亚细胞分辨率之间灵活切换。

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      Chromium单细胞分析

      对多达100万个单细胞开展转录组分析,兼具多组学分析功能。表征组织异质性,发现稀有细胞类型,并逐个细胞解析分子机制。

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      Xenium原位分析

      以亚细胞分辨率定位组织切片中的数百个单分子RNA靶点。对单细胞分析和空间分析揭示的生物学见解进行完善和验证。

    开启您的Visium之旅