Visium空间分析

在组织背景下探索全转录组

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Visium breast cancer sample data

现已发售

通过Visium HD空间基因表达迈入空间发现的新时代

  • 以单细胞级别的分辨率开展全转录组分析
  • 连续的组织覆盖
  • 基于探针的创新化学方法和Visium CytAssist支持的工作流程带来了优异的数据
清晰地观察组织
Visium空间分析平台

探索基因表达的空间排布

Visium平台能够对冷冻和固定的组织切片进行无偏的分子图谱分析,实现简化的组织处理和灵敏的基因检测,并通过用户友好的软件进行基因表达可视化。

Visium hardware
Visium workflow
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分析

灵活的分析,可满足您的需求

分析方案

Visium HD空间基因表达

Visium HD空间基因表达
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Spatial Gene Expression v2 & v1

Spatial Gene Expression v2 & v1

空间基因和蛋白表达

空间基因和蛋白表达

您可以做什么

经过验证的单细胞分辨率和连续覆盖整个组织的全转录组空间分析。

  • Whole transcriptome

同时分析FFPE和冷冻组织切片的分子和成像数据。

  • Whole transcriptome

利用基于探针的化学方法和标记抗体,同时分析FFPE组织的RNA和蛋白表达。

  • Whole transcriptome
  • Protein expression

物种兼容性

人和小鼠

FFPE样本

新鲜冷冻样本

固定冷冻样本

FFPE样本

组织兼容性

FFPE样本

FFPE样本

新鲜冷冻样本

固定冷冻样本

FFPE样本

Capture Area size

6.5 mm x 6.5 mm

6.5 mm x 6.5 mm

11 mm x 11 mm

6.5 mm x 6.5 mm

11 mm x 11 mm

分析物捕获方法

  • 使用CytAssist,基于探针的化学方法(适用于FFPE)
  • CytAssist enabled, probe-based chemistry (for FFPE, fresh frozen, and fixed frozen)
  • Direct Placement, Probe-based chemistry (for FFPE)
  • 使用CytAssist,基于探针的化学方法(适用于FFPE)
  • Visium CytAssist仪器

    简化的样本处理,强大的空间见解

      1
    1. 从标准载玻片上的经典组织学流程开始
    2. 2
    3. 利用仪器将载玻片上的转录本/蛋白信息转移至Visium捕获区域
    4. 3
    5. 继续完成Visium工作流程中的其余步骤
    查看仪器详情
  • Visium CytAssist instrument
  • 空间分析

    直观的软件协助您开展空间分析

    处理空间基因表达数据

    Space Ranger是一套完整的分析流程,可处理Visium空间基因表达数据及明场和荧光显微镜图像,帮助您在组织切片上绘制全转录组数据。

    查看细胞簇和表达模式

    在Space Ranger运行结束后,您可以使用交互式的Loupe Browser桌面软件查看结果。Loupe Browser是一款桌面应用程序,可与Space Ranger分析流程无缝整合,帮助您轻松浏览叠加在原始组织切片图像上的分子表达模式。

    资源和文档

    探索空间生物学的力量

    Enhance your spatial discovery with complementary platforms

    Expand your Visium insights by interrogating single cell profiling with newly discovered mapped cell types or deepen your understanding of specific targets using Xenium subcellular precision.

    • 10x Genomics Chromium Single Cell Platform

      Perform transcriptomic profiling, with multiomic capabilities, in up to a million single cells

      Characterize tissue heterogeneity, discover rare cell types, and dissect molecular mechanisms cell by cell.

    • image

      Target 100’s to 1000’s of RNAs in individual cells across a tissue sample

      Map gene expression at subcellular resolution with a diverse menu of validated, biologically relevant panels

    开启您的Visium之旅

    与10x专家交流