解锁更多样本类型
兼容FFPE组织样本和新鲜冷冻组织样本。
分析整张组织切片
无需提前选择感兴趣的区域，直接分析整张切片上的全转录组。
高分辨率
根据组织类型的不同，每个数据点的平均分辨率为1至10个细胞。
兼容不同的样本
经验证适用于多个物种（人、小鼠、大鼠等）的各种器官。
同时检测蛋白
将全转录组的空间分析与免疫荧光蛋白检测相结合。
简化的数据分析
使用易用的软件将组织学与基因表达数据相结合。
探索您的应用
全面了解疾病复杂性
发现新的生物标志物，鉴定新的细胞类型和状态
定位细胞图谱的空间结构
识别时空基因表达模式
超越组织切片
经过验证的结果
文献
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
Maynard KR, et al. Nature Neuroscience 2021.
Maynard KR, et al. Nature Neuroscience 2021.
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
Fawkner-Corbett D, et al. Cell 2021.
Fawkner-Corbett D, et al. Cell 2021.
TGFβ-blockade uncovers stromal plasticity in tumors by revealing the existence of a subset of interferon-licensed fibroblasts
TGFβ-blockade uncovers stromal plasticity in tumors by revealing the existence of a subset of interferon-licensed fibroblasts
Grauel AL, et al. Nature Communications 2020.
Grauel AL, et al. Nature Communications 2020.
Multimodal analysis of composition and spatial architecture in human squamous cell carcinoma
Multimodal analysis of composition and spatial architecture in human squamous cell carcinoma
Ji AL, et al. Cell 2020.
Ji AL, et al. Cell 2020.
资源
查找有关空间基因表达的最新应用指南及其他文档。
Inside Visium spatial capture technology
Inside Visium spatial capture technology
Brochure, 10x Genomics
Brochure, 10x Genomics
Grant writing resource for Visium Spatial Gene Expression
Grant writing resource for Visium Spatial Gene Expression
Grant Application Resource, 10x Genomics
Grant Application Resource, 10x Genomics
Triple negative breast cancer app note
Triple negative breast cancer app note
App Note, 10x Genomics
App Note, 10x Genomics
完整的解决方案
Visium空间组织优化玻片
可在现有的实验室基础设施中轻松使用，无需购买新仪器。
Visium空间基因表达试剂
利用我们的试剂盒，您可以捕获整张组织切片上的全转录组基因表达和空间分布。
世界级的技术支持和客户支持
您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。
工作流程
- 1
样本制备
达玻片的捕获区。每个捕获区含有数千个带条形码的数据点，每个数据点包含数百万条捕获寡核苷酸，它们都带有这个点特有的空间条形码。
资源 - 2
组织染色和成像
采用标准的固定和染色技术，包括苏木精和曙红（H&E）染色，使用明场显微镜观察玻片上的组织切片。或采用免疫荧光染色，使用荧光显微镜可视化检测玻片上组织切片中的蛋白。
资源 - 3
组织透化和文库构建
对组织进行透化处理，从细胞中释放出mRNA，这些mRNA与数据点上的带有空间条形码的寡核苷酸相结合。通过逆转录反应从捕获的mRNA中生成cDNA。将带有条形码的cDNA合并后进行下游处理，制备出可立即测序的文库。 对于FFPE组织，组织被透化，以便从细胞中释放连接的探针对，其中这些探针对与存在于点上的空间上条形码寡核苷酸结合。通过延伸反应添加空间条形码。然后把条形码标记的分子合并后进行下游处理，以生成可用于测序的文库。
资源 - 5
数据分析和可视化
Space Ranger分析软件可处理您的空间基因表达数据，而Loupe Browser可视化软件可帮助您交互式地探索实验结果。
只有生物信息学家才能使用Loupe吗？
Loupe是点选式软件，任何人都可以轻松下载和使用。
资源
常见问题
它能够助您进行空间转录组学研究，将组织学空间信息与整个转录组基因表达谱（新鲜冷冻组织或FFPE组织）或靶基因表达谱（仅针对新鲜冷冻组织）相结合。
Visium与含mRNA的新鲜冷冻和FFPE组织兼容。我们有单独的试剂盒，它们利用不同的化学方法处理新鲜冷冻组织和FFPE组织。可参阅下文中用Visium分析成功完成内部测试的组织列表。
成功完成测试的组织：新鲜冷冻组织 | FFPE组织
这是一种成熟的技术吗？ Visium是基于空间转录组学的技术，而这种技术在多篇已发表的同行评审文献中得到了证明。您可以在我们的文献页面上进行查看。在Visium的外部验证中，参与测试的客户（如Sanger、SciLife、Broad、USC和Garvan）已经生成了多个不同类型样本的空间基因表达谱。在内部验证中，我们成功验证了30多种不同组织。
10x Genomics提供了两种类型的软件，可帮助您分析数据：Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger这款分析软件能够自动将空间基因表达信息与组织图像相叠加，鉴定出转录图谱相似的数据点集合。随后，您可以使用Loupe Browser可视化软件来交互式地探索实验结果。您可以从10x支持页面上免费下载Space Ranger和Loupe Browser。
适用于FFPE的Visium空间基因表达解决方案无需对组织进行优化。然而，适用于新鲜冷冻样本的Visium空间基因表达解决方案需要对组织进行优化，这是由于两种样本制备过程在化学和分子生物学上的差异。
