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Chromium Single Cell
Chromium Single Cell
Chromium Single Cell

保存検体や品質の低いサンプルを使用

全トランスクリプトーム遺伝子発現解析において、サンプル調製の柔軟性がきわめて高く、スケジュールに沿ってサンプルの固定、バッチ処理およびランを行えます 次のような実験には、Flexをお勧めします

  • 保存検体や品質の低いサンプルを使用

  • サンプルバッチ処理の柔軟性が必要

  • スケールアップの予定があり、細胞あたりのコストを低く抑える必要がある

GEM-X ユニバーサル 3' 遺伝子発現

3’遺伝子発現解析を行う多用途のソリューション(オプションでマルチオミック解析) 次のような実験には、3' 遺伝子発現をお勧めします

  • タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要

  • 遺伝子発現のみが必要。または将来的にATACを使用する可能性あり

  • 必要細胞数が低い

GEM-X Universal 5'遺伝子発現

5’遺伝子発現解析とマルチオミックプロファイリングとを組み合わせた免疫多様性の包括的解析 次のような実験には、5'遺伝子発現をお勧めします。

  • タンパク質同時発現の有無にかかわらず、全長トランスクリプトの情報が必要

  • 今後、RISPRおよびTCR/BCRシーケンシングが必要になるか、選択肢に入るかもしれない

  • 必要細胞数が低い

Primary capability

プローブベースの遺伝子発現

予め設計したプローブ(オプションとしてカスタムプローブ)を用いた遺伝子発現解析

3' 遺伝子発現

遺伝子3'末端付近のRNA分子を検出し定量

5'遺伝子発現

遺伝子5'末端付近のRNA分子を検出し定量

Multiomic capabilities

細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

CRISPRスクリーニング

シングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接捕捉してCRISPR摂動の影響を評価

細胞内タンパク質

核タンパク質、細胞質タンパク質、分泌タンパク質など、細胞全体のタンパク質の検出を実現

細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

細胞表面タンパク質

表面タンパク質マーカーを特定することで、細胞型とバイオマーカーをピンポイントに分類し、細胞のシグナル伝達および相互作用を探索する

CRISPRスクリーニング

シングルセルの解像度レベルで細胞sgRNAと遺伝子発現の変化を直接キャプチャーしてCRISPR摂動の影響を評価

BCR/TCRシーケンシング

全長のB細胞・T細胞ペア型受容体をキャプチャーすることで、クローンの増殖および多様性に関する知見が得られる

抗原特異性

適応免疫応答の詳細な特性を明らかにするために、免疫細胞受容体への抗原の結合を調べる

Compatible species

ヒト

マウス

ラット

非ヒト霊長類

海洋生物

植物

昆虫

その他

ヒト

マウス

非ヒト霊長類(TCR/BCRを除く)

ラット(TCR/BCRを除く)

その他

Compatible sample types

細胞懸濁液

核懸濁液

新鮮組織

凍結組織

FFPE組織

PFA固定組織

FACSソート細胞

固定全血

オルガノイド

細胞懸濁液

核懸濁液

新鮮組織

凍結組織

固定ヒトPBMC

FACSソート細胞

オルガノイド

細胞懸濁液

核懸濁液

新鮮組織

凍結組織(遺伝子発現のみ)

固定ヒトPBMC

FACSソート細胞

オルガノイド

Resolution

全細胞/核

細胞または核がGEMジェルビーズに分配され、それぞれが一意のバーコードを付与されることで、シングルセル解像度を実現します

全細胞/核

細胞または核がGEMジェルビーズに分配され、それぞれが一意のバーコードを付与されることで、シングルセル解像度を実現します

全細胞/核

細胞または核がGEMジェルビーズに分配され、それぞれが一意のバーコードを付与されることで、シングルセル解像度を実現します

Run configuration options

Compatible instruments

Chromium iX、X

Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

Chromium Xo、iX、 X

低コストのXo装置を使用して3'遺伝子発現を実施するか、Chromium iXを用いて10x Genomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

Chromium iX、X

Chromium iXを用いて10xGenomicsのコアアッセイや技術をご利用になるか、Chromium Xを用いて10X Genomicsのシングルセルの全ポートフォリオをご活用ください

Included data processing & analysis software

Cell Ranger

Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

Cloud Analysis

迅速で簡単に結果が得られるように、最適化されたクラウドクラスター上で10xの解析パイプラインのランを実行するプラットフォーム

Cell Ranger

Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

Cloud Analysis

迅速で簡単に結果が得られるように、最適化されたクラウドクラスター上で10xの解析パイプラインのランを実行するプラットフォーム

Cell Ranger

Cell Rangerは、シングルセルデータをお客様が処理できるように無料で提供する解析パイプラインです

Cloud Analysis

迅速で簡単に結果が得られるように、最適化されたクラウドクラスター上で10xの解析パイプラインのランを実行するプラットフォーム

Included interactive visualization tools

Loupe Browser

Loupe Browserでクローンタイプ情報やレパートリーの多様性を遺伝子発現データとともにインタラクティブに探索できます。

Loupe Browser

Loupe Browserでクローンタイプ情報やレートリーの多様性を遺伝子発現データとともにインタラクティブに探索できます。

Loupe Browser

Loupe Browserでクローンタイプ情報やレパートリーの多様性を遺伝子発現データとともにインタラクティブに探索できます

Loupe V(D)J Browser

このインタラクティブな可視化デスクトップソフトウェアを使用して、クローンタイプを調査し、V(D)J転写物を解析できます

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