シングルセル発現解析で複雑な細胞多様性を紐解く

Chromiumシングルセル遺伝子発現ソリューション

従来の遺伝子発現解析を超えて

Chromiumシングルセル遺伝子発現ソリューションは、数百~数万個におよび細胞の特性解析および遺伝子発現プロファイリングを包括的かつ拡張可能に実施できます。最新のバージョンアップにより各細胞におけるより多くのユニークな転写産物の検出が可能となり、さらにFeature Barcodingテクノロジーを加えたことで、各細胞におけるより網羅的な分子リードアウトが入手できるようになりました。例えばCRISPRによる摂動の細胞特異的なターゲット特定、あるいは同一細胞における遺伝子発現と細胞表面タンパク質発現の同時測定など、可能性は広がります。

従来の遺伝子発現解析をはるかに超えて、細胞集団、細胞種、細胞状況およびさらに多くの情報を個々の細胞レベルで特性化できます。腫瘍の不均一性特定や幹細胞組成の評価から神経細胞集団の分離などが可能です。Chromiumシングルセル遺伝子発現ソリューションが提供する素晴らしい技術と解析ソフトウェアの組み合わせで、シングルセルから高度に複雑なライブラリーを作製し、あらゆる種類のサンプルから最大限の知見を得ることができます。

  • 希少な細胞種の同定および特性化
  • 細胞の不均一性を解析し、生命現象に与える影響を理解
  • 既知ターゲット情報を必要とせず、新規ターゲット、バイオマーカー、細胞種類および状態を同定し、シングルセルRNA-Seqで細胞表現型を決定
  • 同一細胞内のmRNAおよび細胞表面タンパク質発現プロファイルの評価
  • 数万個の細胞における高スループットかつ高解像度な機能的遺伝子スクリーニング
  • 各CRISPR摂動に関する包括的な遺伝子発現表現型の評価
Gene Expression Profiling

遺伝子発現プロファイリング

不均一な試料中における細胞間遺伝子発現変動性を明らかにし、希少な細胞種を特定することで、発生および疾患における細胞寄与をより明らかに同定できます。最新バージョンアップにより遺伝子検出感度が大幅に向上したため、各細胞のより多くのユニークな転写産物の検出が可能となりました。

Feature Barcoding Technology: Cell Surface Protein

Feature Barcodingテクノロジー:細胞表面タンパク質

Feature Barcodingテクノロジーを使用した新ワークフローにより、CITE-Seq/REAP-Seq等の文献記載のメソッドをより良好に実行することが可能となります。同一細胞において遺伝子と細胞表面タンパク質の発現を同時に測定することで、タンパク質アイソフォームの同定および低発現転写産物のタンパク質検出が可能となり、解析の表現型特異性がさらに向上します。

Antigen Specificity

Feature Barcodingテクノロジー:CRISPRスクリーニング

Feature Barcodingテクノロジーを用いて、細胞転写産物とともにCRISPRによるターゲット摂動を特定できます。この改良された新しい方法を導入することで、高スループットで拡張可能な機能的遺伝子スクリーニングを、数百~数万個のシングルセルにおいて同時に実施できます。

シングルセル解析を向上させるシステム機能

  • 100~80,000を超える細胞を効率よくパーティション化
  • 優れた感度および最高65%までの細胞回収率
  • シンプルなワークフロー
  • 多様な細胞サイズに対応(下限なし)
  • 1,000個の細胞中0.9%未満という低いダブレット率
  • Next GEMテクノロジーに対応
ワークフローはこちらから
Single Cell Product Family

実験計画ガイド:
シングルセル遺伝子発現

実験のデザイン、パラメータの最適化およびシングルセル遺伝子発現データの最適な分析に必要な計算/解析ツールに関する、あらゆる疑問に本ガイドがお答えします。実験計画ガイドをダウンロードして、シングルセル発現解析技術が提供する豊富な情報を最大限にご活用ください。

実験計画ガイドのダウンロード

すべての細胞を観測する

その仕組みをご覧ください

すべてのランにおいて、数千個のシングルセルを分析します。10xの技術がどのようにして何百万もの反応を同時に実行し、シングルセル解像度での遺伝子発現プロファイリングを可能にするかをご覧ください。


Feature Barcodingテクノロジー

その仕組みをご覧ください

10x GenomicsのソリューションとFeature Barcodingテクノロジーを組み合わせることで、複雑な生物学的システムをいかに深く理解できるかをご覧ください。より完全な細胞リードアウトを各細胞から入手する方法が示されています。可能性は無限大に広がります。

Single Cell Controller

Chromium Controller

コンパクトで洗練された機能的なデザイン

コンパクトで洗練されたChromium Controllerは、サンプルのパーティション化および分子バーコード化の高度な同時進行を可能にします。数10万回~数100万回に相当するピペット操作を、迅速かつ効率的に自動化できるように設計されています。Chromium Controllerは、ゲノムからシングルセルの解析まで、すべてのChromiumソリューションにお使いいただけます。

Chromium Controllerの詳細

製品情報

アプリケーションタイプごとに製品リストを表示することができます。シングルセル遺伝子発現ソリューションのバージョンを選択し、Feature Barcodingテクノロジーのタイプ(複数可能)をお選びください。

Gene Expression Version

Feature Barcode Selection

試薬および消耗品

反応
製品コード
Chromium Chip B Single Cell Kit
1000074
1000073
Chromium i7 Multiplex Kit
96 rxns
120262
Chromium Next GEM Chip G Single Cell Kit
1000127
1000120
Chromium Next GEM Single Cell 3′ GEM, Library & Gel Bead Kit v3.1
1000128
1000121
Chromium Next GEM Single Cell 3’ Library Construction Kit v3.1
16 rxns
1000157
Chromium Single Cell 3′ Feature Barcode Library Kit
16 rxns
1000079
Chromium Single Cell 3′ Feature Barcode Library Kit
16 rxns
1000079
Chromium Single Cell 3′ Library & Gel Bead Kit v2
120267
120237
Chromium Single Cell 3′ Library & Gel Bead Kit v3
1000092
1000075
Chromium Single Cell 3′ Library Construction Kit v3
16 rxns
1000078
Chromium Single Cell A Chip Kit
1000009
120236
Single Index Kit T Set A
96 rxns
1000213

Compatible Partner Products

Biolegend TotalSeq™-A
Biolegend TotalSeq™-B

システム

保証
製品コード
Chromium Controller & Next GEM Accessory Kit
120223
120246
Chromium Controller & Next GEM Accessory Kit
1000202
1000204

ソフトウェア

Cell Ranger Analysis Pipelines
Loupe Browser

ユーザーガイド

Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits User Guide (v3.1 Chemistry)
Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits User Guide (v3.1 Chemistry) with Feature Barcoding technology for Cell Surface Protein
Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits User Guide (v3.1 Chemistry) with Feature Barcoding technology for CRISPR Screening
Demonstrated Protocol: Cell Surface Protein Labeling for Single Cell RNA Sequencing Protocols
Technical Note: Guide RNA Specifications Compatible with Feature Barcoding Technology for CRISPR Screening
User Guide : Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits (v3 Chemistry) with CRISPR Screening Feature Barcoding Technology
User Guide: Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits (v3 Chemistry)
User Guide: Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits (v3 Chemistry) with Cell Surface Protein Feature Barcoding Technology
User Guide: Chromium Single Cell 3′ Reagents v2
シングルセル遺伝子発現データセット
学術セミナー

シングルセル遺伝子発現データ解析を始めよう

 
  • 寺倉 伸治, PhD
Senior Field Application Scientist, North APAC, 10x Genomics
September 12, 2019

シングルセル解析のためのサンプル調製:秘訣とコツ

 
  • 寺倉 伸治, PhD
Senior Field Application Scientist, North APAC, 10x Genomics
September 11, 2019
ポスター

High throughput immune profiling using integrated single cell multi-omics analyses

  • Single Cell Biology Keystone Symposia
    Breckenridge, CO
    January 2019

Single cell ATAC-seq for characterization of complex biological systems

  • Single Cell Biology Keystone Symposia
    Breckenridge, CO
    January 2019

Single cell ATAC-seq for characterization of complex biological systems

  • Human Cell Atlas Conference
    Cambridge, MA
    November 2018

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