无需写代码,Loupe帮助您深入开展Seurat分析

LoupeR是一个R软件包，可以从Seurat对象中创建Loupe Browser文件。有了LoupeR，无需命令行数据处理即可在Loupe中无缝探索Seurat数据。

从经处理的样本和对照样本比较的实验中寻找差异表达的基因

轻松开展并迭代进行多样本比较。

对感兴趣基因的表达进行快速可视化

轻松绘制出差异表达的结果图

交互式探索差异表达基因的热图和小提琴图。

轻松注释细胞类型

从头开始定义或完善现有的细胞类型。

快速生成交互式的差异表达分析

重新分析数据子集,寻找新的细胞类型

将范围缩小到感兴趣的细胞类型上,或过滤掉低质量的数据。

点几下鼠标即可创建高分辨率图像

Loupe Browser可以轻松生成SVG和PNG格式的图像,以便在PPT或论文中共享。

利用高级过滤功能表征细胞

采用布尔运算符创建一组自定义的规则,将目标锁定在特定的条形码组合。

探索多个数据模态,包括单细胞V(D)J、ATAC和空间基因表达

Loupe Browser支持10x Genomics全套单细胞和空间数据集分析。