Chromium 细胞核分离方案

简化工作流程以消除样本制备的复杂性

可便捷高效地制备冷冻样本,用于单细胞核测序,简化用户的实验过程,并改善更多样本的获得途径。确保用统一的样本制备工作流从多种组织类型获得可靠结果,同时还可优化该工作流程后与Chromium基因表达和染色质可及性分析共用。

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细胞核分离方案

Resources:

  • 今天即可开始使用

    易于使用,无需了解单细胞测序专业知识。

  • 节约宝贵时间和珍贵样本

    排除了组织解离和细胞核分离中的不确定因素。

  • 结果可靠

    可靠的标准化试剂专为10x Genomics单细胞分析而设计。

解析真正的组织成分

通过保留在新鲜组织解离过程中经常丢失的细胞,更全面地表征组织的异质性。利用简化的细胞核分离,避免会导致基因表达改变并产生细胞类型偏倚的长时间酶孵育过程。

揭示基因调控机制

采用细胞核捕获基因表达和染色质可及性信息,探究推动细胞分化、发育和疾病的基因调控相互作用。

保持用户样本的生物学状态

及时冻存用户样本,保持生物学状态。将样本运送到核心研究机构进行制备,或存储样本以备后续使用,最大限度减小基因表达的变化。

拓展用户存储样本的能力

运用新的单细胞技术再次评价生物库中保存的冷冻组织,并解决历史遗留的尚未得到解决的科学问题。

可靠的结果

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视频

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资源

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Sample preparation for single cell applications in oncology

Sample preparation for single cell applications in oncology

Sample Preparation Guide, 10x Genomics

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Sample preparation optimization guide with Single Cell Gene Expression LT

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Sample Preparation Guide, 10x Genomics

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Multiply your power of discovery, simplify your workflows

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Multiome/Nuclei Isolation Flyer, 10x Genomics

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我们的端对端解决方案

细胞核制备

一体化试剂盒利用标准实验室设备,无需专门的仪器。

选择您的单细胞分析方法

细胞核可用于捕获染色质可及性或整体转录组基因表达图谱。

数据分析与可视化软件

数据分析软件

数据可视化软件

世界级技术与客户支持

可通过电话或email联系我们的专家支持团队。

工作流程

向下滚动查看用于Chromium细胞核分离的基本工作流程。

  1. 1Step 1

    获的样本

    从用户感兴趣的冻存组织开始。可兼容样本类型包括小鼠心脏、肝脏、大脑和多种人肿瘤。

    参考资料
  2. 2Step 2

    解离冻存组织

    使用提供的研棒和裂解缓冲液将冻存组织碾碎形成均匀的混合液。

    参考资料
  3. 3Step 3

    分离细胞核

    将均质化的组织通过提供的离心柱,以从破碎的样本中分离出细胞核。

  4. 4Step 4

    去除细胞碎片

    使用所提供的细胞碎片清除液和缓冲洗涤液纯化细胞核悬液

  5. 5Step 5

    重悬细胞核与QC

    在建议的重悬缓冲液中重悬细胞核,检查细胞核质量,接着进行所选择的单细胞分析。

    参考资料

常见问题

我们用下列冻存组织对Chromium细胞核分离试剂盒做了验证:小鼠心脏、肝脏、大脑、肺脏、肾脏、小肠和多种人类肿瘤。在该网站可以查阅所测试组织的最新列表:10x Genomics支持网页。该试剂盒与细胞悬液、植物或昆虫材料、钙化组织或FFPE组织不兼容。

所支持的组织用量范围为每个组织解离柱3-50mg。对于更大的组织块,需要将这些组织切成不大于50mg的碎块,并采用多个组织解离柱,在最后一步合并细胞核。对<3mg的组织块也有可能进行分析,但产率却决于组织类型。

获得较纯的细胞核悬液所需的所有试剂耗材均包含于该试剂盒中,采用标准实验室设备。不需要专门的仪器。

可兼容的单细胞分析包括Chromium单细胞ATAC、单细胞多组学ATAC + 基因表达、单细胞基因表达和固定RNA分析。遵照细胞核重悬建议进行用户正在运行的特定分析。不需要对单细胞工作流程做任何改动。

10x Genomics提供数据分析与可视化软件,帮助用户分析自己的单细胞数据。遵照分析建议进行感兴趣的单细胞分析。对于单细胞基因表达分析,确保分析过程中包括内含子。用户可从10x Genomics支持网页免费下载Cell Ranger和Loupe Browser软件。

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单细胞ATAC

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单细胞多组学ATAC + 基因表达

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单细胞基因表达

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单细胞基因表达Flex

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性能

  • 通过开放染色质分析进行表观基因组学研究
  • 在同一个单细胞核中进行转录组和开放染色质的联合分析
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 多样本混合检测
  • Whole transcriptome gene expression
  • 多样本混合检测

扩展应用

  • 细胞表面蛋白
  • CRISPR筛选
  • 多样本混合检测
  • 细胞表面蛋白
  • 多样本混合检测

仪器

  • Chromium X系列单细胞系统
  • Chromium Controller
Single Cell Gene Expression

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