新一代的单细胞分析从GEM-X开始。查看产品说明,了解详细参数和数据

Chromium 单细胞基因表达

逐个细胞地揭示细胞多样性的错综复杂之处

Chromium单细胞基因表达解决方案提供了数万个细胞的单细胞转录组3’基因表达分析和多组学分析。将每个细胞的基因表达、细胞表面蛋白或CRISPR编辑分析相结合,可探索细胞异质性、新颖靶点和生物标志物。

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单细胞基因表达

Resources:

  • 高通量单细胞分析

    捕获样品中数百个至数万个细胞的完整异质性。

  • 多组学细胞读数

    可检测3’ mRNA、细胞表面蛋白、CRISPR扰动及其他。

  • 行业领先的性能表现

    细胞捕获率高,可灵敏检测稀有转录本以及以往无法捕获的RNA含量较低的细胞,让您对数据充满信心。

  • 简化的数据分析

    强大且直观的软件有助于探索和解释单细胞基因表达谱

  • 为期一天的实验室流程

    在一天之内完成从样本到可测序文库的过程。

  • 兼容不同的样本

    经过验证适用于新鲜和冷冻的样本,以及完整的细胞和细胞核。

GEM-X技术的优势

灵敏度、通量、数据质量和细胞捕获率均有提高

GEM-X技术推动了新一代Chromium分析的发展,为现在及未来的更强大的单细胞研究奠定了基础。改进的微流控技术、分析试剂和软件更新相互配合,最大限度地增加了重要见解。

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10x Chromium Single Cell Gene Expression hardware, software, and reagents.

检测到的基因多达2倍

与之前的版本相比,灵敏度大幅提高

通量提高2倍

分析规模扩展,以更低成本实现更高通量

多细胞比例降低2倍

数据质量提高,在细胞数量一定的情况下,多细胞率减少

细胞捕获率高达80%

细胞捕获率提高,充分利用每一次运行

灵活的解决方案 满足您各种需求

Product Family

单细胞基因表达的标准

Chromium单细胞基因表达解决方案可以满足您的各种需求--从处理大型项目到发现基因表达的多样性,逐个细胞地进行解析。

获得初步见解

开启您的单细胞基因表达实验--使用可以负担的适用于小型项目的解决方案进行试点研究或优化实验条件。

单细胞基因表达解决方案

开启您的单细胞发现之旅。仅需500-1,000个细胞即可进行试点研究,启动初步研究或进行样本制备优化。

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    获得初步见解

    通过小规模研究,从500-1,000个细胞中找到可揭示的内容。

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    优化样本制备

    优化实验条件,最大程度地提高您的研究成功率。

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    从样本制备到数据分析的全面支持

    从技术资源到用户友好的基于云的数据分析,都将为您提供端到端的支持。

多组学分析

同时测量细胞表面蛋白表达或CRISPR扰动与3’基因表达。

CRISPR筛选 (Next GEM)

通过对细胞内sgRNA的直接捕获和基因表达的变化,以单细胞分辨率评估CRISPR扰动带来的影响。

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CRISPR筛选
  • 筛选与疾病相关的新型基因靶点或耐药性的驱动因素
  • 通过更快的流程和更高的分辨率开展功能性遗传筛选
  • 揭示发育过程中复杂的基因调控通路
观看CRISPR网络研讨会
细胞表面蛋白

综合分析单细胞的基因和蛋白表达,以便发现新的细胞亚群和罕见的细胞群体。

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细胞表面蛋白
  • 通过额外的蛋白信息来丰富对不同细胞表型的认识
  • 通过同步的单细胞检测来探索转录组与蛋白组之间的关系
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大规模项目

处理您最雄心勃勃的项目,从药物筛查到临床前试验,并为大型项目提供补充解决方案。

单细胞基因表达HT (Next GEM)

在新的Chromium X上通过高通量 (HT) 基因表达和多组学分析扩展您的实验可能性并使百万细胞研究成为常规实验。

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了解更多Chromium X的信息
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    加快获得结果的时间

    在单张芯片中一次分析数十万个单细胞,多达 16 个样本。

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    通过更大规模的实验来享受经济的检测

    通过结合3’ CellPlex进行混样分析和靶向基因表达,降低实验和分析成本,并完成您最重视的项目。

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    提供从样本制备到结果分析的完整方案

    从技术资源到用户友好的基于云的数据分析工具,您都可以获得端到端的支持。

采用3’ CellPlex进行样本多路复用 (Next GEM)

使用端到端的样本多路复用解决方案扩展您的单细胞研究,利用跨物种兼容标记可以最多将12个样本进行混合。

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    解锁更多见解

    通过多路复用实现更大的细胞核样本通量,降低样本成本,并扩展到更大的单细胞实验室。

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    广泛的样本兼容性

    通过统一的与各种样品和物种兼容的试剂来实现多样本标记,包括病人样本,动物模型,细胞系,以及整个细胞或细胞核。

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    完整的解决方案

    利用具有多路分解功能的完全受支持的实验方案和集成的数据分析流程,有效地进行大规模的单细胞实验。

自动化工作流程

通过Chromium Connect单细胞基因表达解决方案获得一致性高、重复性好的结果,最大限度地提高实验室生产力。

自动化单细胞基因表达解决方案 (Next GEM)

基于Chromium Connect的自动化基因表达工作流程,助力您探索细胞异质性,发现新的目标和生物标志物,并以提高生产力来揭示复杂的细胞过程。

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了解更多关于Chromium Connect
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    优化生产力

    缩短手动操作时间,从单细胞到可以测序的基因表达文库,实现无人值守的便捷。

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    将您的工作流程标准化

    在多个实验室、用户、甚至多个站点生成一致且可重复的单细胞基因表达结果。

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    流线操作

    采用预先分装的自动化专属试剂,这些试剂采用颜色编码和2D条形码,用于防错试剂跟踪和加载。

经过验证的结果

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视频

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文献

Single-cell RNA-seq reveals cell type–specific molecular and genetic associations to lupus

Single-cell RNA-seq reveals cell type–specific molecular and genetic associations to lupus

Richard K Perez, et al. Science (2022).

Richard K Perez, et al. Science (2022).

Single-cell atlas reveals correlates of high cognitive function, dementia, and resilience to Alzheimer’s disease pathology

Single-cell atlas reveals correlates of high cognitive function, dementia, and resilience to Alzheimer’s disease pathology

Hansruedi Mathys, et al. Cell (2023).

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An autocrine signaling circuit in hepatic stellate cells underlies advanced fibrosis in nonalcoholic steatohepatitis

An autocrine signaling circuit in hepatic stellate cells underlies advanced fibrosis in nonalcoholic steatohepatitis

Shuang Wang, et al. Science Translational Medicine (2023).

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资源

查找有关Chromium单细胞基因表达的最新应用指南及其他文档

Getting Started with Gene Expression Guide

Getting Started with Gene Expression Guide

Experiment Planning Guide, 10x Genomics

Experiment Planning Guide, 10x Genomics

Grant Application Resources for Chromium Single Cell Gene Expression

Grant Application Resources for Chromium Single Cell Gene Expression

Grant Application Resources, 10x Genomics

Grant Application Resources, 10x Genomics

The neXt generation of single cell starts with GEM-X

The neXt generation of single cell starts with GEM-X

GEM-X Single Cell Flyer, 10x Genomics

GEM-X Single Cell Flyer, 10x Genomics

完整的解决方案

基于GEM-X技术的Chromium仪器

通量灵活、可拓展

Chromium单细胞基因表达试剂

利用我们的试剂盒,您可以捕获和扩增3’ mRNA,鉴定CRISPR扰动或开展其他应用。

分析和可视化软件

数据分析流程

数据可视化软件

世界级的技术支持和客户支持

您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。

您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队,邮箱地址:[email protected]

常见问题

它提供了一种全面的方法,来分析基因表达(全转录组或靶向),以及细胞表面蛋白或CRISPR编辑对复杂生物学的多维见解。

只要是表达聚腺苷酸化mRNA分子的细胞类型,都与该单细胞RNA-seq流程兼容。

Chromium单细胞基因表达与新鲜、固定(甲醇)和冷冻的单细胞或单细胞核悬液兼容。兼容的物种包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。

10x Genomics提供了两种类型的软件,可帮助您分析数据:Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger这款分析软件能够自动生成每个细胞的表达谱,并鉴定表达谱相似的细胞簇。随后,您可以利用Loupe Browser可视化软件来交互式地探索实验结果。您可以从10x支持网站上免费下载Cell Ranger和Loupe Browser。

浏览10x支持网站

我们在内部测试了直径最大达到30微米的细胞。此外,许多客户文献也成功证明了对各类细胞的兼容性,如肝细胞、成纤维细胞和心肌细胞,它们的大小往往超过30微米。

Next GEM芯片和GEM-X芯片作为Chromium工作流程的一部分,都能高效生成乳液微滴(GEM)。不过,GEM-X芯片采用的是能提供更高性能的新技术,其结构、设置和微滴大小都在Next GEM和传统分析的基础上进行了优化。GEM-X芯片只能在Chromium X和iX仪器上运行,这些仪器支持我们所有的Chromium分析。

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单细胞多组学ATAC + 基因表达

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单细胞ATAC

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性能

  • Whole transcriptome gene expression
  • 多样本混合检测
  • 全长配对的TCR/BCR序列
  • 5’全转录组基因表达
  • 在同一个单细胞核中进行转录组和开放染色质的联合分析
  • 通过开放染色质分析进行表观基因组学研究

扩展应用

  • 细胞表面蛋白
  • 多样本混合检测
  • 细胞表面蛋白
  • 抗原特异性
  • CRISPR筛选

仪器

  • Chromium X系列单细胞系统
Single Cell Gene Expression

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