Visium 空間遺伝子解析

HD 3' 遺伝子発現

次世代Visium HDテクノロジーを基にして、全トランスクリプトームを網羅し、さまざまな生物種から幅広い情報を取得するアッセイ Centrillion社のライセンスに基づき製造

拡大した空間探索に推奨されるVisiumアッセイ

シングルセルスケールの解像度

HD 3'遺伝子発現を選択する理由

  • 新鮮凍結組織サンプルにより、さまざまな生物種に対応

  • 新しい発見の可能性(アイソフォーム、BCR/TCRおよびSNVの検出)

アッセイ仕様

    生物種

  • さまざまな生物種に対応

    対応サンプル

  • 新鮮凍結組織

    マルチオミックス

  • 3'遺伝子発現
  • 形態学的解析(HE)
  • アイソフォーム発現(実現の可能性)
  • TCRおよびBCRのシーケンス(実現の可能性)

    スループット

    キャプチャーサイズ: 6.5 x 6.5 mm

アッセイ構成要素

Visium Spatial

HD 3' Gene Expression

HD User Guides
Compatible instruments

独自のVisium HD 3'実験を組み上げる

自身の研究に適した実験をデザインしましょう

ユーザーガイド

シーケンス要件

最終的な遺伝子発現ライブラリーは、組織で完全に覆われたキャプチャーエリアに対して5億5千万リードペアの推奨最小深度でシーケンスされます。

更なる詳細

資料

Visium HD 3'による空間探索の深化

Visium HDデータ解析の開始と外部ツール

Space Ranger解析パイプライン

無償の解析パイプライン:入力ファイルタイプを処理し、Visiumシーケンスデータを組織画像に合わせて調整する。そして、オプションの細胞セグメンテーションを実施

Loupe Browser

Desktop application for Windows and MacOS that allows you to interactively visualize data.

Cloud Analysis

Cloud Analysisにより、ご使用のウェブブラウザから迅速かつ容易にCell Rangerパイプラインにアクセスできます。

Visium HD WTパネル

シングルセルスケールで包括的な差次的遺伝子発現解析を行うプローブベースの空間遺伝子発現アッセイ