Visium 空間解析

HD WTパネル遺伝子発現

Next-generation Visium HD technology–powered assay with protein coding gene coverage and archival tissue compatibility.

専門家に聞く詳細はこちら

ヒトおよびマウスに適した推奨Visiumアッセイ

シングルセルスケールの解像度

HD WTパネル遺伝子発現の利点

    FFPE、新鮮凍結、固定凍結サンプルを含む幅広いサンプルに対応 Visium HDアッセイにおいて効率の良いシーケンスを実現

アッセイの仕様

生物種

Mouse
Human

サンプルタイプ

FFPE tissue
Fresh frozen tissue
Fixed frozen tissue

マルチオミクス

Probe-based
gene expression
Protein
Morphology

Visium CytAssist

Visium CytAssist

スループット

Capture Area size: 6.5 x 6.5 mm

アッセイの構成

実験において、Visium HDスライド、コア試薬、Visium CytAssistが必要です。何が必要か分からない場合には、Experiment Builderを使用し、実験にとって最適なカスタムリストを参照ください。

価格のお問い合わせ

Consumables

Index Kit

REAGENT

1000251

Dual Index Kit TS Set A, 96 rxn

Core Slides and Reagents

REAGENT

1000675

Visium HD, Human Transcriptome, 6.5 mm, 4 rxns

REAGENT

1000673

Visium HD, Human Transcriptome, 6.5 mm, 16 rxns

REAGENT

1000676

Visium HD, Mouse Transcriptome, 6.5 mm, 4 rxns

REAGENT

1000674

Visium HD, Mouse Transcriptome, 6.5 mm, 16 rxns

Starter Kits and Accessories

ACCESSORY

1000469

Visium 6.5mm Slide Cassette, 4 pk

ACCESSORY

1000470

Visium 11mm Slide Cassette, 4 pk

ACCESSORY

1000471

Visium CytAssist Tissue Slide Cassette, 4 pk, 6.5 mm

ACCESSORY

1000472

Visium CytAssist Tissue Slide Cassette, 4 pk, 11 mm

RNAase Inhibitor (Optional)

REAGENT

1000887

Kit, RNase Inhibitor 40x

Compatible Instrument

Visium CytAssist
Visium HD graphic
Visium HD実験系を構築

実験に適したVisium HDをデザインします。

建設開始

製品資料

すべての技術資料を見る

ユーザーガイド

ユーザーガイドを閲覧

サンプル調製

Visium HD FFPE 組織調製ハンドブックVisium HD新鮮凍結組織のための調製ハンドブックVisium HD固定凍結組織のための調製ハンドブック

テクニカルノート

Visium HD空間遺伝子発現イメージングガイド

シーケンス要件

最終的な遺伝子発現ライブラリーは、組織で完全に覆われたキャプチャー領域に対して推奨される最少深度2億7,500万リードペアで配列決定されます。

View more

解析ガイド

Visium HD WTパネル遺伝子発現解析の実践ツアーVisium HD WTパネル遺伝子発現データの核のセグメンテーションおよびカスタムビニング

予算申請資料

Visium空間遺伝子発現を使った研究のための予算申請関連の情報サポートレターの作成

関連資料

https://cdn.10xgenomics.com/image/upload/f_auto,q_auto/v1/products/Visium%20HD/Resources/launch-webinar
固定と新鮮凍結サンプルに関するウェビナー
視聴する
https://cdn.10xgenomics.com/image/upload/f_auto,q_auto/v1/products/Visium%20HD/Resources/intro-to-biology-in-hd
Visium HDの紹介―組織の詳細を明らかにする空間解析
ブログを読む
https://cdn.10xgenomics.com/image/upload/f_auto,q_auto/v1/products/Visium%20HD/Resources/getting-started-with-third-party-tools
Visium HDと解析ツール
ブログを読む

データ解析

空間解析ソフトを探る
Space Ranger Analysis Pipelines
Space Ranger Analysis Pipelines

Free analysis pipelines that process the input file types to align Visium sequencing data with the tissue image.

Learn about Space Ranger
Loupe Browser
Loupe Browser

Loupe BrowserはデスクトップアプリケーションでWindowsとMacOSに対応しており、直感的なデータの視覚化ができます。

Cloud Analysis
Cloud Analysis

Cloud Analysisはウェブブラウザーから迅速かつ簡単にCell Rangerパイプラインにアクセスができます。

データセットの一例

すべてのデータセットを見る

Visium HD WT Panel Gene Expression Libraries, Post-Xenium, Human Lung Cancer (FFPE)

データセットを見る

Visium HD WT Panel Gene Expression Library, Human Breast Cancer (Fresh Frozen)

データセットを見る

Visium HD WT Panel Gene Expression Library, Mouse Brain (Fresh Frozen)

データセットを見る

関連製品

Visium製品の比較
Visium HD 3’
Visium HD 3’

Versatility meets resolution in our species agnostic Visium HD assay, offering 3’ whole transcriptome spatial gene expression at single cell scale

Learn more
Visium v2 WT Panel
Visium v2 WT Panel

A proven probe-based solution for whole transcriptome spatial gene expression across tissue conditions, with options for multiomic analysis

Learn more
Visium v1 3’
Visium v1 3’

Our original 3' poly(A) whole transcriptome spatial gene expression assay

Learn more