プローブベースのアプローチを用いて、シングルセルからのトランスクリプトーム（ヒトまたはマウス）の包括的なプロファイリングを可能にします。Feature Barcode技術の追加により、細胞表面タンパク質発現の同時プロファイリングが可能になり、複雑な生物学への多面的な知見が得られます。また、このアッセイによりサンプルのマルチプレックスが可能になり、スループットとワークフローの効率を向上させることができます。

比較試験において、シングルセル遺伝子発現Flexアッセイの感度は、シングルセル3'遺伝子発現アッセイの2倍であることが示されました。

サンプルの固定化によって、細胞の状態が維持されるため、シングルセル解析を困難にする時間的な制限がなくなります。固定化のプロトコールは、貴重であったり壊れやすかったりするサンプルを、採取地点から中央施設（コア検査室や受託会社など）まで輸送して処理することを可能にします。

また、固定化によってサンプルのバッチ処理がより効率的になり、ワークフローの利便性が高まるとともにばらつきも抑えられます。固定化は感染性物質を中和する働きもあり、このステップの適切なバリデーションが行われた後は、サンプルをBSL-3実験室で取り扱う必要がなくなる場合があります。

このアッセイはヒトおよびマウスのサンプルに対応しています。新鮮または凍結させたシングルセル・核の懸濁液または組織から出発して10x Genomicsの固定プロトコールに従うか、FFPE組織から出発して、10x Genomicsの実証済みプロトコールに従ってFFPEサンプルから組織を解離し、シングルセル遺伝子発現Flexに使用できるようにします。

Fresh human and mouse samples are compatible with this option. Prior to fixation, whole cells can be labeled with antibody-oligonucleotide conjugates (using Feature Barcode technology) to profile cell surface proteins alongside gene expression.

Cell Rangerは、各細胞の発現プロファイルを自動的に生成し、類似した発現プロファイルを持つ細胞のクラスターを特定する解析パイプラインです。その後、視覚化ソフトウェアLoupe Browserを使用して、結果をインタラクティブに探索することができます。どちらのツールもサポートサイトから自由にダウンロードでき、10x Genomicsのデータセットをお客様ご自身のコンピュータで解析することができます。

10x Genomics Cloud Analysis（現在米国とカナダでのみ使用可能）では、シンプルなウェブインターフェースを通じ、最適化されたスケーラブルなインフラを活用することで、シングルセル遺伝子発現Flexのデータを処理して迅速に結果を得ることができるようになります。ユーザーは、このクラウドのインターフェースを通じてCell Rangerパイプラインのセットアップおよび実行が可能です。