プローブベースのアプローチを用いて、シングルセルからのトランスクリプトーム（ヒトまたはマウス）の包括的なプロファイリングを可能にします。Feature Barcode技術の追加により、細胞表面タンパク質発現の同時プロファイリングが可能になり、複雑な生物学への多面的な知見が得られます。また、このアッセイによりサンプルのマルチプレックスが可能になり、スループットとワークフローの効率を向上させることができます。

比較試験において、シングルセル遺伝子発現Flexアッセイの感度は、シングルセル3'遺伝子発現アッセイの2倍であることが示されました。

サンプルの固定化によって、細胞の状態が維持されるため、シングルセル解析を困難にする時間的な制限がなくなります。固定化のプロトコールは、貴重であったり壊れやすかったりするサンプルを、採取地点から中央施設（コア検査室や受託会社など）まで輸送して処理することを可能にします。

また、固定化によってサンプルのバッチ処理がより効率的になり、ワークフローの利便性が高まるとともにばらつきも抑えられます。固定化は感染性物質を中和する働きもあり、このステップの適切なバリデーションが行われた後は、サンプルをBSL-3実験室で取り扱う必要がなくなる場合があります。

このアッセイはヒトおよびマウスのサンプルに対応しています。新鮮または凍結させたシングルセル・核の懸濁液または組織から出発して10x Genomicsの固定プロトコールに従うか、FFPE組織から出発して、10x Genomicsの実証済みプロトコールに従ってFFPEサンプルから組織を解離し、シングルセル遺伝子発現Flexに使用できるようにします。

このオプションはヒトおよびマウスの新鮮サンプルに対応しています。固定化の前に、（Feature Barcodeテクノロジーを利用して）全細胞を抗体-オリゴヌクレオチド結合体で標識することで、遺伝子発現と同時に細胞表面タンパク質のプロファイリングを実行することができます。

Cell Rangerは、各細胞の発現プロファイルを自動的に生成し、類似した発現プロファイルを持つ細胞のクラスターを特定する解析パイプラインです。その後、視覚化ソフトウェアLoupe Browserを使用して、結果をインタラクティブに探索することができます。どちらのツールもサポートサイトから自由にダウンロードでき、10x Genomicsのデータセットをお客様ご自身のコンピュータで解析することができます。

10x Genomics Cloud Analysis（現在米国とカナダでのみ使用可能）では、シンプルなウェブインターフェースを通じ、最適化されたスケーラブルなインフラを活用することで、シングルセル遺伝子発現Flexのデータを処理して迅速に結果を得ることができるようになります。ユーザーは、このクラウドのインターフェースを通じてCell Rangerパイプラインのセットアップおよび実行が可能です。