Chromium シングルセル免疫プロファイリング

免疫多様性を細胞ごとにマルチオミックスプロファイリング

Chromiumシングルセル免疫プロファイリングは、免疫学の課題に対しマルチオミックスのソリューションを提供します。B細胞またはT細胞受容体のペア配列、表面タンパク質発現、抗原特異性、遺伝子発現を1つの細胞から解析することができます。

シングルセル免疫プロファイリング
  • マルチオミックスサイトメトリー

    マルチオミックスサイトメトリー

    高感度な5’mRNA検出と同時に抗原特異性をフェノタイピング

  • 完全な免疫レパトア

    完全な免疫レパトア

    アイソタイプを含むIgおよびT細胞受容体α/βの完全長ペア配列

  • 免疫マッピング

    免疫マッピング

    免疫レパトアと抗原特異性をシングルセルの分解能で組み合わせ

  • 効率化されたデータ解析

    効率化されたデータ解析

    使いやすいソフトウェアでクローンタイプの情報を探り、視覚化

  • ラボ作業は1日

    ラボ作業は1日

    わずか1日でサンプルからシーケンス可能なライブラリーを作製

  • 多様なサンプルに対応

    多様なサンプルに対応

    PBMC、新鮮および凍結細胞サンプル、組織解離細胞からの検証済みプロトコール

さらなる可能性を探る

  • 新しい細胞の種類と機能を発見

  • 免疫レパトアを包括的に解析

  • 抗原特異性を探索

  • 新しいバイオマーカーの発見

Flexible solutions to meet your needs

Product Family

Single cell resolution for comprehensive immune profiling

Chromium Single Cell Immune Profiling lets you explore the incredible diversity of the innate and adaptive immune system with multiomic readouts and flexibility of scale.

Multiomic analysis

Simultaneously measure cell surface protein expression and antigen specificity with 5’ gene expression.

Immune Repertoire Profiling

Understand clonal expansion and diversity by capturing full-length, paired B-cell and T-cell receptors at a single cell level.

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Immune Repertoire Profiling
  • Paired receptor sequence enables re-expression and testing for antigen binding and function
  • Combined with gene expression data, perform immune cell classification and discover new cell states
Cell Surface Protein

Correlate gene expression measurements with immunophenotyping at a single cell level to better delineate immune cell subsets and functional states.

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Cell Surface Protein
  • Enable ultra-high parameter discovery, using multiomic cytometry to detect up to hundreds of proteins simultaneously with unbiased gene expression profiling
  • Stratify immune cell populations by correlating protein isoforms with regulatory network co-expression in single cells
Antigen Specificity

Assess the specificity of the adaptive immune system at single cell resolution with simultaneous capture of paired T-cell receptors and peptide–MHC multimers, or immunoglobulin heavy and light chains and their cognate antigens.

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Antigen Specificity
  • Explore public and private T-cell antigen specificities using barcoded peptide–MHC multimers
  • Characterize how neoantigens may be targeted by the adaptive immune system
  • Accelerate antibody discovery with a faster and higher throughput screening technology

Large-scale projects

Tackle your most ambitious projects, from rare cell type discovery to translational studies, with our high-throughput (HT) kit and complementary solutions for larger-scale projects.

Single Cell Immune Profiling HT

Transform single cell immune profiling with high-throughput (HT) multiomic analysis on the new Chromium X, and reveal the incredible diversity of the adaptive immune system.

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Learn More About Chromium X
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    Accelerate time to results

    Analyze hundreds of thousands of single cells in a single chip for up to 16 samples at once.

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    Enjoy economy of scale

    Take advantage of high-throughput capabilities and reduce experimental and analysis costs even further with Targeted Gene Expression.

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    Support from prep to analysis

    From technical resources to user-friendly, cloud-based data analytics, you are supported end-to-end.

Targeted Gene Expression

Profile a defined set of transcripts to reduce costs while increasing sample number or sequencing depth with customizable, comprehensive gene panels.

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    Built to scale

    Maximize sample throughput and reduce hands-on time by multiplexing libraries during target enrichment.

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    Seamless integration

    Don’t miss any data—seamlessly transition between whole transcriptome and targeted analysis from the same library.

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    More for less

    As studies scale, maximize your budget by decreasing sequencing costs with pre-designed or custom targeted panels.

Workflow automation

Maximize lab productivity and obtain consistent, reproducible results with Single Cell Immune Profiling for Chromium Connect.

Automated Single Cell Gene Expression

Automate your immune profiling workflow on the Chromium Connect to explore T- and B-cell repertoire diversity, identify rare cell populations, and reveal clonal expansion in response to disease and therapy with increased productivity.

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    Optimize productivity

    Shorten your hands-on time, and go from single cells to sequencing-ready immune profiling libraries with walk-away convenience.

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    Standardize your workflow

    Generate consistent and reproducible single cell immune profiling results across experiments, users, and even across multiple sites.

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    Streamline operations

    Utilize pre-aliquoted, automation-specific reagents that are color-coded and 2D-barcoded for error-proof reagent tracking and loading.

実績のある結果

実績のある結果

ビデオ

研究者がどのようにChromiumシングルセル免疫プロファイリングを使っているかご覧下さい。

エンドツーエンドのソリューション

Next GEM技術を用いたChromium装置

Next GEM技術を用いたChromium装置

コンパクトな装置

自動化装置

Chromium シングルセル免疫プロファイリング試薬

Chromium シングルセル免疫プロファイリング試薬

5' mRNA、完全長対のBCRおよびTCR配列、抗原受容体特異性、細胞表面タンパク質などを含む多次元的アプローチで適応免疫を探索できる試薬キット

解析・視覚化ソフトウェア

解析・視覚化ソフトウェア

データ解析パイプライン

視覚化ソフトウェア

グローバルな技術・カスタマーサポート

グローバルな技術・カスタマーサポート

専門サポートチームがメールと電話で対応

ワークフロー

シングルセル免疫プロファイリングの基本的なワークフローをご覧ください。細胞表面タンパク質や抗原特異性にFeature Barcodeキットを使用する場合は、細胞を修飾するための専用プロトコールを用意しています。

  1. 1Step 1

    サンプルの準備

    数百から数千の細胞から始めます。それぞれの細胞は、独自のオリゴバーコードでタグ付けされた抗体および/またはペプチド-MHCで標識します。FACS/MACS、穿刺吸引細胞、TIL、PBMCsなどからの細胞懸濁液も使用できます。

    リソース
  2. 2Step 2

    10xライブラリーの構築

    試薬キットとChromium Controller装置を使用して、10xバーコードを付加したライブラリーを構築します。Chromium Controllerでは、10xバーコードがついたゲルビーズを加えてそれぞれの細胞を分画化します。ナノリットル単位で分画された液滴内部では、細胞は逆転写によりcDNAを作成します。1つの細胞から作成されたcDNAには、共通の10xバーコードが付加されています。

    リソース
  3. 3Step 3

    シーケンス

    10xバーコードが付加されたライブラリーは、標準的なNGSショートリードシーケンサー(イルミナ)と互換性があります。数千個にもわたるそれぞれの細胞から、免疫および転写プロファイリングを実施します。

    リソース
  4. 4Step 4

    データ解析

    シーケンス生データから生物学的に意味のある情報に変換するには、Cell Rangerを使います。Cell Rangerは無償提供されており、重鎖/軽鎖シーケンス、遺伝子発現、そして抗原特異性のデータを処理します。

    解析パイプライン出力

    出力にはQCの情報およびファイルが作成され、10xのLoupe視覚化ソフトウェア、サードパーティのR、Pythonツールで使用できます。

    リソース
  5. 5Step 5

    データの視覚化

    Loupe Browser 視覚化ソフトウェアを使用して、結果をインタラクティブに探索します。 サンプルや細胞タイプ内およびサンプルや細胞タイプ間の詳細なクロノタイプ情報を比較し、遺伝子使用状況、レパトア多様性、クローン増大などを解析できます。

    バイオインフォマティシャンが必要ですか?

    Loupeは、誰でも簡単にダウンロードして使用できるクリックベースのソフトウェアです。

    リソース

よくある質問

このソリューションは複数のデータタイプをひとつのシングルセルから同時検出して統合解析をできます。これにはmRNAベースの全トランスクリプトームあるいはターゲット遺伝子発現、免疫フェノタイピング、適応免疫レパトアのクローン性と多様性、抗原特異性を含みます。細胞を特徴づけるマルチオミックスアプローチにより、免疫システムを細胞ごとに理解できます。

はい。免疫グロブリンまたは TCRのライブラリーのみを増幅しシーケンスできます。増幅された全トランスクリプトーム cDNAは、保存しておけば後でシーケンスすることもできます。

Chromiumシングルセル免疫プロファイリングは、新鮮または凍結保存されたシングルセル懸濁液と互換性があります。代表的なサンプルには、PBMCs、腫瘍浸潤リンパ球、脾臓、骨髄細胞、その他の組織タイプが含まれます。種は、ヒト、マウス、ラット、および他のモデル生物から選択することができます。なお、免疫グロブリンまたはTCRシーケンスについては、現在10x Genomics試薬とプロトコールでサポートされているのはヒトとマウスのみです。

Chromiumシンブルセル免疫プロファイリングソリューションは、IgおよびTCR遺伝子の不変領域に遺伝子特異的増幅プライマーが設計されていています。これにより、可変領域、多様性領域、および結合遺伝子セグメントにわたる配列を濃縮し、シーケンスします。

はい、免疫グロブリン重鎖配列は、IgA、IgD、IgE、IgM、およびIgGによって分類されます。

関連製品

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シングルセル免疫プロファイリング

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シングルセル遺伝子発現解析

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空間的遺伝子発現

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シングルセルATAC

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性能
  • TCR/BCR全長ペアシーケンス
  • 5' 全トランスクリプトーム(遺伝子発現)
  • ターゲット遺伝子発現
  • 組織における3' 全トランスクリプトーム(遺伝子発現)
  • ターゲット遺伝子発現
  • サンプルマルチプレックス
  • 組織における3' 全トランスクリプトーム(遺伝子発現)
  • ターゲット遺伝子発現
  • FFPEと凍結切片組織の両方に対応
  • オープンクロマチンによるエピゲノムプロファイリング
拡張機能
  • サンプルマルチプレックス
  • 免疫蛍光タンパク質の同時検出
装置
Single Cell Gene Expression

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