The next generation of single cell starts with GEM-X. Check out the Product Sheet for specs and data

Chromium シングルセル免疫プロファイリング

免疫多様性を細胞ごとにマルチオミックスプロファイリング

Chromiumシングルセル免疫プロファイリングは、免疫学の課題に対しマルチオミックスのソリューションを提供します。B細胞またはT細胞受容体のペア配列、表面タンパク質発現、抗原特異性、遺伝子発現を1つの細胞から解析することができます。

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シングルセル免疫プロファイリング

Resources:

  • マルチオミックスサイトメトリー

    Phenotype cells in greater detail by combining gene expression data with 100s of proteins.

  • 完全な免疫レパトア

    アイソタイプを含むIgおよびT細胞受容体α/βの完全長ペア配列

  • 免疫マッピング

    免疫レパトアと抗原特異性をシングルセルの分解能で組み合わせ

  • 効率化されたデータ解析

    使いやすいソフトウェアでクローンタイプの情報を探り、視覚化

  • ラボ作業は1日

    わずか1日でサンプルからシーケンス可能なライブラリーを作製

  • Scalable solutions

    Find the kit that fits your research, with throughput capabilities for hundreds to tens of thousands of cells.

GEM-X advantage

Increased sensitivity, throughput, data quality, and sample recovery

GEM-X technology drives our next generation of Chromium assays and lays the foundation for more powerful single cell research, now and in the future. Improved microfluidics, assay reagents, and software updates all work together to maximize critical insights.

Learn more about Chromium innovation and GEM-X advancements
10x Chromium Single Cell Gene Expression hardware, software, and reagents.

Up to 2x more genes detected

Substantially increased sensitivity compared to previous versions

2-fold increase in throughput

Built to scale with higher throughput at a lower cost

2-fold reduction in multiplet rate

Enhanced data quality with fewer multiples for a given number of cells

Up to 80% cell capture efficiency

Improved sample recovery makes the most of every run

目的に応じたソリューションの数々

Product Family

包括的な免疫プロファイリングのためのシングルセル解像度

Chromium シングルセル免疫プロファイリングは、自然免疫系と適応免疫系の驚くべき多様性を、マルチオミックスの系でデータを読み取り実験規模を変更しながら探索します。

マルチオミックス解析

細胞表面タンパク質の発現と抗原特異性を5'遺伝子発現と同時に測定します。

免疫レパトアプロファイル

B細胞やT細胞の受容体の全長配列をシングルセルレベルで捉えることで、クローンの拡大や多様性を理解します。

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免疫レパトアプロファイル
  • ペアになった受容体の配列から、抗原結合や機能を調査
  • 遺伝子発現データと組み合わせることで、免疫細胞の分類を行い、新しい細胞の状態を探索
細胞表面タンパク質

シングルセルレベルでの遺伝子発現測定と免疫フェノタイピングを相関させることで、免疫細胞のサブセットや機能状態をより明確にします。

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細胞表面タンパク質
  • マルチオミックスサイトメトリーを用いて、数百種類ものタンパク質を同時に検出。バイアスのない遺伝子発現プロファイリングを行うことで、超高パラメーターでの探索が可能
  • 同じ細胞内でタンパク質のアイソフォームと制御ネットワークの共発現を相関させることで、免疫細胞集団を層別化
Barcode Enabled Antigen Mapping (Next GEM)

Obtain comprehensive antigen-specific cellular profiles—including full-length paired V(D)J sequences, gene expression, and cell surface proteins from the same single cell—to identify rare, antigen-reactive T and B cells for accelerating therapeutic discovery.

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Antigen Specificity
  • Discover antigen-specific clonotypes with full-length, paired V(D)J sequences, gene expression, and surface protein expression from the same single cell
  • Go from sample to antigen-specific immune repertoire sequencing data in a week
  • Explore and interpret antigen–clonotype relationships with easy-to-use analysis and visualization software
CRISPR Screening

Assess effects of CRISPR perturbations at single cell resolution with direct capture of cellular sgRNAs and resulting perturbed phenotypes, including gene expression and/or cell surface proteins.

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  • Screen for novel gene targets or resistance drivers involved in disease
  • Empower functional genetic screens with a faster workflow and increased resolution
  • Unravel the complex genetic regulatory pathways involved in development
Learn more about Single Cell CRISPR screening

大規模プロジェクト

ハイスループット(HT)キットと大規模プロジェクト用のソリューションにより、希少な細胞型の発見からトランスレーショナルリサーチまで、最も意欲的なプロジェクトに取り組むことが可能です。

シングルセル免疫プロファイリング HT (Next GEM)

新しいChromium Xでは、シングルセル免疫プロファイリングにハイスループット(HT)マルチオミクス解析を導入し、適応免疫系の驚くべき多様性を明らかにできます。

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Chromium Xの詳細はこちら
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    結果までの時間を大幅に短縮

    1つのチップで最大16サンプル、数十万個のシングルセルを同時解析

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    スケールメリットを享受

    ハイスループット機能を活用し、ターゲット遺伝子発現により、実験や解析のコストをさらに削減

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    事前準備から解析までサポート

    技術的なリソースから、ユーザーフレンドリーなクラウドベースのデータ解析(米国のみ)まで、エンドツーエンドでのサポート

ワークフロー自動化

Chromium Connectのシングルセル免疫プロファイリングを使うと、ラボの生産性を最大化し、安定した再現性のある結果を得ることが可能

自動化されたシングルセル免疫プロファイリング (Next GEM)

Chromium Connectで免疫プロファイリングのワークフローを自動化。T細胞やB細胞のレパトア多様性探索、希少な細胞集団の特定、疾患や治療に応じたクローン増大を明らかにし、生産性を向上させる

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Chromium Connectの詳細はこちら
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    生産性の向上

    シングルセルからシーケンス用のライブラリー作製までを自動化。ハンズオンタイムを短縮し、免疫プロファイリングの利便性を実現

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    ワークフローを標準化

    実験、ユーザー、さらには複数のサイトにまたがり安定して再現性のあるシングルセル免疫プロファイリング結果を生成

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    オペレーションの効率化

    自動化専用試薬を使用し、カラーコードと2Dバーコードによって試薬のトラッキングやローディングを確実に実行

実績のある結果

研究者がどのようにChromiumシングルセル免疫プロファイリングを使っているかご覧下さい。

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Chromiumシングルセル免疫プロファイリングの最新アプリケーションノートや製品資料をご覧ください。

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ビデオ

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論文

Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial

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Jun Tian, et al. Nature Medicine (2023).

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Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens

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Francesco Maura, et al. Nature Cancer (2023).

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Transcriptional signatures associated with persisting CD19 CAR-T cells in children with leukemia

Transcriptional signatures associated with persisting CD19 CAR-T cells in children with leukemia

Nathaniel Anderson, et al. Nature Medicine (2023).

Nathaniel Anderson, et al. Nature Medicine (2023).

リソース

Chromiumシングルセル免疫プロファイリングの最新アプリケーションノートや製品資料をご覧ください。

A New Way of Exploring Immunity—Linking Highly Multiplexed Antigen Recognition to Immune Repertoire and Phenotype

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Application Note, 10x Genomics

Application Note, 10x Genomics

Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale

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Application Note, 10x Genomics

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The neXt generation of single cell starts with GEM-X

The neXt generation of single cell starts with GEM-X

GEM-X Single Cell Flyer, 10x Genomics

GEM-X Single Cell Flyer, 10x Genomics

エンドツーエンドのソリューション

Next GEM技術を用いたChromium装置

拡張可能な装置

Chromium シングルセル免疫プロファイリング試薬

5' mRNA、完全長対のBCRおよびTCR配列、抗原受容体特異性、細胞表面タンパク質などを含む多次元的アプローチで適応免疫を探索できる試薬キット

解析・視覚化ソフトウェア

Our data processing platform

データ解析パイプライン

視覚化ソフトウェア

グローバルな技術・カスタマーサポート

専門サポートチームがメールと電話で対応

よくある質問

このソリューションは複数のデータタイプをひとつのシングルセルから同時検出して統合解析をできます。これにはmRNAベースの全トランスクリプトームあるいはターゲット遺伝子発現、免疫フェノタイピング、適応免疫レパトアのクローン性と多様性、抗原特異性を含みます。細胞を特徴づけるマルチオミックスアプローチにより、免疫システムを細胞ごとに理解できます。

はい。免疫グロブリンまたは TCRのライブラリーのみを増幅しシーケンスできます。増幅された全トランスクリプトーム cDNAは、保存しておけば後でシーケンスすることもできます。

Chromiumシングルセル免疫プロファイリングは、新鮮または凍結保存されたシングルセル懸濁液と互換性があります。代表的なサンプルには、PBMCs、腫瘍浸潤リンパ球、脾臓、骨髄細胞、その他の組織タイプが含まれます。種は、ヒト、マウス、ラット、および他のモデル生物から選択することができます。なお、免疫グロブリンまたはTCRシーケンスについては、現在10x Genomics試薬とプロトコールでサポートされているのはヒトとマウスのみです。

Chromiumシンブルセル免疫プロファイリングソリューションは、IgおよびTCR遺伝子の不変領域に遺伝子特異的増幅プライマーが設計されていています。これにより、可変領域、多様性領域、および結合遺伝子セグメントにわたる配列を濃縮し、シーケンスします。

はい、免疫グロブリン重鎖配列は、IgA、IgD、IgE、IgM、およびIgGによって分類されます。

Next GEM and GEM-X chips both efficiently generate Gel Beads-in-emulsion (GEMs) as part of the Chromium workflow. However, GEM-X chips use new technology that provides higher performance, with architecture, settings, and partition size all optimized based on a wealth of experience from Next GEM and Legacy assays. GEM-X chips run exclusively on our Chromium X and iX instruments, which support the full breadth of our Chromium assays.

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性能

  • 組織における3' 全トランスクリプトーム(遺伝子発現)
  • サンプルマルチプレックス
  • Whole transcriptome gene expression
  • サンプルマルチプレックス
  • 同一核からの遺伝子発現とクロマチンプロファイリングの組み合わせ
  • オープンクロマチンによるエピゲノムプロファイリング

拡張機能

  • Cell Surface Protein
  • CRISPRスクリーニング
  • サンプルマルチプレックス
  • Cell Surface Protein
  • サンプルマルチプレックス

装置

  • Chromium X シリーズ
Single Cell Gene Expression

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