Visium 空間解析

V1 3' 遺伝子発現

Visum テクノロジーを搭載した初めてのアッセイで全トランススクリプトーㇺをカバーし、様々な生物種に対応します。

Visum HDテクノロジーにアップグレードすることで、シングルセル解像度で隙間のない組織解析を実現

1-10細胞解像度を達成した第一世代のスライドデザイン

アッセイの仕様

    生物種

  • 様々な種に対応

    サンプルタイプ

  • 新鮮凍結組織

    マルチオミクス

  • 3'遺伝子発現

  • タンパク質

  • 形態

  • アイソフォーム発現

  • TCRおよびBCRシーケンス

    対応装置

    マニュアル

    スループット

    キャプチャーサイズ:6.5 x 6.5 mm

アッセイの構成

Visium Spatial

v1 3' Gene Expression

User Guides

ユーザーガイド

シーケンス要件

最終的な遺伝子発現ライブラリーは組織で覆われたキャプチャースポット当たり、5万リードペアという推奨最少深度でシーケンスされます。サンプルによっては、より少ないリード数で十分な場合もありまる一方、より複雑なサンプルでは、より多くのリード数が必要になる場合があります。

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Space Ranger Analysis Pipelines image

Space Ranger Analysis Pipelines

Free analysis pipelines that process the input file types to align Visium sequencing data with the tissue image and perform optional cell segmentation.

Loupe Browser image

Loupe Browser

Loupe BrowserはデスクトップアプリケーションでWindowsとMacOSに対応しており、直感的なデータの視覚化ができます。

データセットの一例

Visium HD WT Panel

Probe-based spatial gene expression assay for comprehensive differential gene expression at single cell scale.

Visium HD 3'

Species agnostic 3' poly(A) capture-based spatial gene expression assay for expanded whole transcriptome discovery applications.

Visium v2 WT Panel

First-generation Visium technology-powered assay with protein coding gene coverage and immuno-oncology protein panel.

Visium空間解析

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