Visium 空間解析
第一世代Visiumテクノロジーを原動力に、タンパク質をコードする遺伝子を網羅し、免疫オンコロジータンパク質パネルを使用するアッセイv2 WTパネル遺伝子発現
Visium HDテクノロジーを活用することで、シングルセルスケールの解像度で隙間のない組織解析を実現
第一世代スライドデザインは1～10細胞解像度を提供
v2遺伝子発現を選択する理由
がん免疫にフォーカスしたタンパク質パネルによるマルチオミックスなオプション
11 mm x 11 mm のキャプチャーエリアにより、大きなサイズの組織にも対応
アッセイ仕様
マウス
ヒト
生物種
FFPE組織
新鮮凍結組織
固定凍結組織
対応サンプル
プローブベースの遺伝子発現
タンパク質
形態学的解析
ヒトがん免疫タンパク質パネル
マルチオミックス
対応装置
スループット
キャプチャーサイズ： 6.5 x 6.5 mm
キャプチャーサイズ： 11 x 11 mm
アッセイ構成要素
Visium Spatial
v2 WT Panel Gene Expression
Compatible instruments
製品資料
ユーザーガイド
サンプル調製
シーケンス要件
最終的な遺伝子発現ライブラリーは、組織で覆われたキャプチャースポット1ヵ所に対して2万5千リードペアの推奨最小深度でシーケンスされます。最終的なタンパク質発現ライブラリーは、組織で覆われたキャプチャースポットに対して5千リードペアの推奨深度でシーケンスされます。
データ解析
Space Ranger 解析パイプライン
入力ファイルタイプを処理し、Visiumシーケンスデータを組織画像に合わせて調整します。オプションの細胞セグメンテーションを実施する無償の解析パイプライン
