Xenium分析

为快速探索和洞察数据而设计

我们一流的机载分析可在运行过程中自动处理数据,无需在运行后等待数小时的数据处理。有了我们直观的可视化软件Xenium Explorer,原位数据的探索变得前所未有的简单。

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Xenium breast cancer sample data
Xenium分析仪的机载分析

在运行结束后立即开始探索数据

Xenium能够在图像采集和生化循环的同时处理图像,立即获得可解读的数据。Xenium机载分析自动解码转录本和分割细胞,无需在仪器运行结束后通过复杂而耗时的步骤来处理数据。

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看看Xenium如何将图像转化为丰富的生物数据

对数据充满信心

在利用Xenium Explorer进一步探索数据之前,快速轻松地开展仪器质控。

通过多模态分割生成真正的单细胞空间数据

我们的人工智能算法经过Xenium数据的训练,可提供灵活的细胞分割。它使用每个细胞的最佳信号,并利用其分割方法对细胞进行标记。

    自由选择数据的存储和分析方式

    完全拥有数据,无需额外付费

    您可以将数据从仪器传输到您选择的存储设备。数据完全归您所有,无需支付额外的费用。

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    灵活开放的文件格式,无需额外处理

    Xenium分析仪以开放的格式生成数据,允许您使用Xenium Explorer或第三方软件来处理。

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Xenium Explorer

从整个组织到单个转录本的无缝探索

Xenium Explorer是一款适用于Windows和MacOS的桌面应用程序,能够对Xenium分析仪生成的数据进行交互式可视化。

在任何规模下查看转录本定位

Xenium Explorer提供了多个高性能选项来实现转录本数据的可视化。在组织水平,您可以查看转录本密度图,或根据转录本密度对细胞进行着色。在细胞水平,您可以放大单个转录本。

比较基因表达和细胞邻域

定位独特的空间生态位,然后利用套索工具轻松比较不同组织微环境中的基因表达。

与病理学流程相整合

将Xenium数据直接叠加在同一张切片的H&E和DAPI图像上,实现无缝比对和探索。

结合免疫荧光(IF)图像,探索RNA与蛋白之间的关联

简单注册后,即可在Xenium Explorer中直接查看同一张切片的H&E和IF图像。

未来发布的产品将带来更多功能

    创建病理学注释

    在H&E或IF图像上对组织结构进行注释,然后直接与分子读数进行比较。

    Annotation layer

    探索UMAP投影

    以熟悉的降维投影方式探索Xenium单细胞数据。

    Alignment layer

    开展单细胞风格的分析

    定义细胞类型和细胞簇,分析区域间的差异表达,并导出高分辨率图像。

    Analysis clusters
Xenium Ranger

用Xenium Ranger重新分析数据,然后用Xenium Explorer进行可视化

Xenium Ranger分析流程与多个Linux发行版兼容,可轻松地重新分析您的机载分析数据,然后在Xenium Explorer中进行可视化。

    Import segmentation

    导入分割结果

    Xenium Ranger可利用第三方工具生成的分割结果重新分配转录本,然后在Xenium Explorer中进行可视化。

    Annotation layer

    注释层

    Select the best stains and customize parameters to resegment Xenium data using our latest cell segmentation models and algorithm.

    Analysis clusters

    重新标记

    在Xenium分析仪运行结束后需要重新标记转录本?使用重新标记流程,生成完全修正的Xenium数据。

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