空间转录组学

直观呈现组织样本的全新视角

揭示每个“事件”的“位置”

细胞之间的关系以及它们在组织样本中的相对位置对于理解疾病病理学至关重要。空间转录组学是一项开创性的技术,让科学家能够测定组织样本中的所有基因活动,并定位该活动发生的位置。这项技术已经促成了一些新发现,这些成果将帮助科学家更好地了解生物过程和疾病。

工作原理

使用空间捕获技术促进您的空间发现

空间捕获技术通过使用空间条形码mRNA结合寡核苷酸为Visium Spatial平台提供动力。mRNA分子获得空间条形码有两种方法。

在新鲜冷冻组织中,组织被固定并透化以释放与相邻捕获探针结合的RNA,从而捕获基因表达信息。然后从捕获的RNA和测序文库合成cDNA。

在FFPE组织中,组织被透化以释放与玻片上相邻捕获探针结合的连接探针对,从而捕获基因表达信息。对蛋白质编码转录组中每个基因特异的成对探针与它们的基因靶标杂交,然后彼此连接。探针对被扩展以包含空间条形码和准备好的测序文库的补充。

研讨会

在组织微环境的背景下探索基因表达

空间基因表达技术的创新让科学家能够在形态学背景下全面了解细胞。在这个报告中,您将听到10x Genomics的科学家介绍技术上的突破性改进以及用户展示的令人兴奋的应用。

Visualization Controls

Use the sliders under the tissue image to adjust how you visualize and combine the tissue image and the gene expression data. Colors represent clusters identified by differentially expressed genes.

Gene Identification

By placing the pointer above a gene name within the table, spots in the tissue image will be colored based on the expression of that gene. Alternatively, by placing the pointer above a value within the table, you can observe the expression of a specific gene with the spots from an individual cluster highlighted.

  • 超越基因表达

    超越基因表达

    将转录组和蛋白质组数据叠加到染色的图像上,以前所未有的方式了解组织微环境。揭示新发现的细胞类型、细胞状态和生物标志物的空间排布。
  • 整体解决方案

    整体解决方案

    这个简化的工作流程与不同物种(人、小鼠、大鼠等)的多个样本类型兼容,让您能够在一天之内完成从组织切片到可测序文库的全过程。
  • 标准工具

    标准工具

    与实验室现有的组织分析方法和工具轻松整合。将免疫荧光染色与成像相结合,在空间背景下实现多组学鉴定。
  • 简化的数据分析

    简化的数据分析

    通过Space Ranger分析软件来处理数据,并通过Loupe Browser可视化软件来交互式探索结果,您可以分析和了解基因和蛋白表达的异质性。
  • 现已接受订购