高感度かつ細胞下レベルの分解能で遺伝子をin situ視覚化マッピング
In Situ解析は、組織切片上に細胞そして細胞下レベルの分解能で標的遺伝子の発現マップを作成します。これにより空間的なトランスクリプトームデータをさらに強固で精緻に捉えることができます。複雑な細胞ネットワークやその関係を詳細にマッピングすることで、疾患につながる生物学的プロセスをより明確に解明します。この技術はすでに細胞アトラス、神経変性疾患、免疫学、がんなどの新たな知見に貢献しています。
細胞間の関係性をマッピング
細胞および細胞下レベルでの空間的情報を詳細にマッピングし、関心のある標的遺伝子にフォーカス
組織形態の保存
新鮮凍結、固定凍結、FFPE組織から遺伝子とタンパク質の発現を同時検出し、データをH&E画像にマッピング
空間情報とシングルセルデータを補完
安定した高感度かつ特異的なin situのエンドツーエンドワークフローでVisium空間的トランスクリプトームおよびシングルセルデータを強化
特長
- 最適なケミストリーと統合ハードウェアによりエンドツーエンドのワークフローを提供し、10xのソフトウェアと視覚化ツールで高解像度の空間的データを出力解析
- 同一組織切片上のタンパク質とRNAターゲットを同時に細胞下レベルの分解能で高感度・高特異的に解析
- 事前に設計されたパネルやオプションでカスタム化も可能な柔軟性の高いソリューション
- 高出力の生物学的研究と前臨床コホートベースのデザインを可能にするスループット
論文
細胞間の関係を明らかに：発生から健常・疾患まで
研究者がどのようにin situ解析を使って細胞関係をマップし、空間的なトランスクリプトームデータをさらに理解しているかをご覧ください。
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer’s Disease
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Chen et al. Cell. 2020.
Chen et al. Cell. 2020.
Spatial and temporal localization of immune transcripts defines hallmarks and diversity in the tuberculosis granuloma
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Carow et al. Nature Communications. 2019
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A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart
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Asp et al. Cell. 2019
Asp et al. Cell. 2019
製品開発状況
10x Genomicsは現在、Cartana社と ReadCoor社の技術の強みを組み合わせて、将来のIn Situ解析技術の開発を進めています。