Chromiumシングルセル

ユニバーサル 3' 遺伝子発現

トランスクリプトーム全体をキャプチャーし、多様な生物種から広範な情報を収集するGEM-X技術を用いたRTベースのアッセイ

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細胞回収率最大80%

これまでのNext GEM技術に比べて最大100%の高い感度

使いやすいリード、シーケンシングコストを最大50%節約

ユニバーサル 3' 遺伝子発現を選択する理由

    全長トランスクリプトーム情報が必要
    サンプルあたり細胞500~20,000個という柔軟なスループット
    タンパク質および遺伝子発現を含む幅広いマルチオミックスオプション

アッセイの仕様

対応する生物種

マウス
ヒト
ラット
非ヒト霊長類
海洋生物
植物
昆虫
その他

対応するサンプルの種類

細胞懸濁液
核懸濁液
新鮮組織
凍結組織
FACSソート細胞
固定ヒトPBMC
オルガノイド

マルチオミックス機能

3' 遺伝子発現
細胞表面タンパク質

互換性のある装置

Chromium X

ラン構成

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シングルプレックス

2万細胞/サンプル
16万細胞/チップ
8サンプル/チップ

オンチップマルチプレックス

5,000細胞/サンプル
4万細胞/チップ
最大4サンプル/流路出力、8サンプル/チップ

アッセイ構成要素

個々の実験に必要なのは、チップ、インデックスキットおよびコア試薬ですが、オプションでバーコード化キットを使用できます。必要なものが不明な場合は、実験ビルダーをご使用ください。お客様の実験に必要な品目のリストを作成できます。

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Consumables

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Nuclei Isolation (optional)

REAGENT

1000494

Chromium Nuclei Isolation with RNase Inhibitor Kit, 16rxns

Chip

CHIP

1000747

Kit, GEM-X OCM 3' Chip Kit v4 4-plex, 2 chips

Index Kit

REAGENT

1000215

Dual Index Kit TT Set A 96 rxns

REAGENT

1000242

Dual Index Kit NT Set A, 96 rxn

Core Reagents

REAGENT

1000779

GEM-X Universal 3’ Gene Expression v4 4-plex, 16 samples

Core Reagents (optional)

REAGENT

1000825

GEM-X Universal 3' Gene Expression cDNA Kit v4, 16 samples

Library Construction Kit (optional)

REAGENT

1000694

Library Construction Kit C, 16 rxns

REAGENT

1000774

Library Construction Kit C, Automated 24 rxns / Manual 32 rxns

Feature Barcoding Kit (optional)

REAGENT

1000702

Chromium GEM-X Single Cell 3 Feature Barcode Kit v4, 16 rxns

RNase Inhibitor (Optional)

REAGENT

1000887

Kit, RNase Inhibitor 40x

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最低20,000ペアリード/細胞で遺伝子発現解析、5,000ペアリード/細胞でタンパク質解析

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注目論文

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シングルセルアトラスは、高い認知機能、認知症、ならびにアルツハイマー病における回復の病理の相関関係の解明につながる

Cell, 2023

Hansruedi Mathys, et al.

PubMedリンク

非アルコール性脂肪肝炎における線維症進行の基礎にあるのは、肝星状細胞の自己分泌シグナル伝達回路である

Science Translational Medicine, 2023

Shuang Wang, et al.

PubMedリンク

シングルセルRNA-seqにより、ループスにおける細胞型特異的分子および関係遺伝子を解明する

Science, 2022

Richard K Perez, et al.

PubMedリンク

注目データセット

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10,000個ヒトDTCメラノーマ、Chromium GEM-Xシングルセル3’

データセット

Total-Seq-BヒトTBNKカクテルで染色した10,000個ヒ末梢血単核細胞(PBMC)、Chromium GEM-Xシングルセル3

データセット

Chromium Nuclei Isokationキットで抽出した10,000個成体マウス脳核、Chromium GEM-Xシングルセル3’

データセット
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