全トランスクリプトームまたはターゲット遺伝子発現プロファイルと、細胞表面タンパク質、CRISPR修飾などを同時に得ることで複雑な生命科学に多次元的な見方を加えることができます。

ポリアデニル化されたmRNA分子を発現している細胞はすべて、このシングルセルRNA-seqワークフローと互換性があります。

Chromiumシングルセル遺伝子発現は、新鮮、固定（メタノール）、凍結保存されたシングルセルまたは核懸濁液と互換性があります。種は、ヒト、マウス、ラット、モデル生物、植物など多岐にわたります。

10x Genomicsではデータの解析用に2種類のソフトウェア、Cell RangerとLoupe Browserを提供しています。Cell Rangerは、各細胞の発現プロファイルを自動的に作成し、類似した発現プロファイルを示す細胞のクラスタを識別する解析ソフトウェアです。その後、視覚化ソフトウェアLoupe Browserを使用して、結果をインタラクティブに探索することができます。Cell RangerとLoupe Browserは、10x Supportのサイトから無料でダウンロードできます。

10x Genomicsでは直径30μmまでの細胞をテストしています。多くのお客様の論文では、肝細胞、線維芽細胞、心筋細胞など、一般的に30μmをはるかに超えるサイズの細胞を使い実証されています。

Next GEMとGEM-Xチップはいずれも、Chromiumのワークフローの一環としてエマルジョン中のゲルビーズ（GEM）を効率的に生成します。しかし、GEM-Xチップにはより高いパフォーマンスを発揮する新技術が使用されており、基本設計、設定および細胞分画サイズはすべて、Next GEMおよびこれまでのアッセイから得られた豊富な経験に基づいて最適化されています。GEM-Xチップは、10xの全範囲のChromiumアッセイをサポートするChromium XおよびiX機器でのみ使用できます。