Chromium 多组学细胞术

超高参数的单细胞多组学表型分析

通过分析数百个细胞表面蛋白以及基因表达,以单细胞分辨率鉴定复杂的细胞悬液。逐个细胞地获得复杂生物学的高分辨率视图,并拓宽您的探索范围。

多组学细胞术

Resources:

  • 超高参数

    超高参数

    通过测定数百个细胞表面表位的丰度来扩展蛋白质组学探索。

  • 单细胞多组学

    单细胞多组学

    同时分析mRNA和细胞表面蛋白,以及TCR/Ig序列和抗原特异性。

  • 无缝的工作流程

    无缝的工作流程

    与流式细胞术的染色步骤相似,不存在光谱重叠或参数限制。

  • 快速的周转时间

    快速的周转时间

    从细胞染色到立即可测序的文库,整个过程最快只需一天。

  • 简化的数据分析

    简化的数据分析

    通过易用的软件来探索和查看多种类型的数据。

  • 兼容不同的样本

    兼容不同的样本

    经验证适用于PBMC、新鲜和冷冻的细胞系以及解离的组织。

探索您的应用

  • 对复杂的细胞亚型进行分型

  • 发现新的细胞类型和功能

  • 发现新的生物标志物

  • 筛选抗原特异性的T细胞

久经考验的结果

久经考验的结果

视频

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文献

A pan-cancer blueprint of the heterogeneous tumor microenvironment revealed by single-cell profiling

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Cell Research. Junbin Qian et al., 2020.

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Broad immune activation underlies shared set point signatures for vaccine responsiveness in healthy individuals and disease activity in patients with lupus

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Nature Medicine. Yuri Kotliarov et al., 2020.

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Single-cell multiomic analysis identifies regulatory programs in mixed-phenotype acute leukemia

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Nature Biotechnology. Jeffrey M Granja et al., 2019

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完整的解决方案

基于Next GEM技术的Chromium仪器

基于Next GEM技术的Chromium仪器

小巧灵活

Chromium单细胞试剂

Chromium单细胞试剂

使用我们的试剂盒,您可以获得单细胞的多维度全面视图,包括mRNA、细胞表面蛋白、全长配对的BCR和TCR序列,以及抗原-受体特异性。

分析和可视化软件

分析和可视化软件

数据分析流程

数据可视化软件

世界级的技术支持和客户支持

世界级的技术支持和客户支持

您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。

必需的组件

您可以使用10x Genomics及其兼容伙伴的下列产品,实现多组学细胞术。

单细胞免疫分析

单细胞基因表达

工作流程

  1. 1Step 1

    制备您的样本

    通过与独特的寡核苷酸条形码偶联的TotalSeq™–B/C抗体来标记细胞。与此同时,您也可以通过流式抗体染色来富集感兴趣的细胞群。细胞经过洗涤,接着进行10x文库的构建。

    资源
  2. 2Step 2

    构建您的10x文库

    采用我们的试剂盒和Chromium Controller构建带有条形码的10x文库。Chromium Controller将每个带有10x条形码的凝胶珠的细胞封装在单个液滴中。在每个纳升级的液滴中,mRNA和细胞表面蛋白的转录本都经过逆转录生成cDNA,其中单个细胞的所有cDNA都带有共同的10x条形码。

    资源
  3. 3Step 3

    测序

    第2步所生成的10x条形码文库与Illumina测序仪上的标准短读长NGS测序兼容,能够实现数千个单细胞的分析。

    资源
  4. 4Step 4

    数据分析

    Cell Ranger将原始的测序数据转化成有生物学意义的见解。Cell Ranger可处理基因表达和细胞表面蛋白文库的数据。

    分析流程输出

    输出结果包括质控信息和文件,这些文件可轻松用于Loupe Browser可视化软件或第三方工具的进一步分析。

    资源
  5. 5Step 5

    数据可视化

    使用我们的Loupe Browser,您可以根据基因表达和细胞表面蛋白来定义和比较细胞类型。

    只有生物信息学家才能使用吗?

    Loupe是点选式软件,任何人都可以轻松下载和使用。

    资源

常见问题

在流式细胞分析中,由于固有的光谱重叠,可测定的蛋白数量受到限制,但Feature Barcode技术能够测定数百个参数,而无需进行荧光补偿。我们比较了分别从流式细胞术和Feature Barcode信号中获得的荧光强度和UMI计数的分布。结果表明,两种技术所产生的细胞分布图谱非常一致。采用多组学细胞术,您还可以将每个细胞的基因表达、T/B细胞的TCR/Ig序列以及抗原特异性信息相叠加,从而准确地鉴定细胞身份、状态和功能。

应用指南:通过基因表达和细胞表面蛋白的大规模同时测定来改善单细胞鉴定

您可以将寡核苷酸与目的抗体进行定制偶联,以便用于10x Genomics的流程。您可以选择BioLegend的定制偶联服务,也可以选择Abcam的定制偶联试剂盒,获得或创建与寡核苷酸偶联的定制抗体。

了解更多

如果您有意富集特定的细胞群或稀有的细胞类型,您可以在10x Genomics文库制备之前分选细胞。在分选之前,采用寡核苷酸偶联抗体和流式抗体对细胞进行染色。

细胞表面蛋白的分析可单独开展,而无需进行基因表达或免疫分析。细胞在染色后被分液到GEM中,其中cDNA分子被加上条形码。使用所产生的cDNA来生成细胞表面蛋白文库。

10x Genomics提供了数据分析和可视化软件,包括Cell Ranger、Loupe Browser和Loupe V(D)J Browser。Cell Ranger是一套分析流程,能够根据每个细胞的基因和/或蛋白自动生成表达谱,并识别细胞簇。之后可使用我们交互式的可视化软件Loupe Browser和Loupe V(D)J Browser来观察和解释结果。

相关产品

产品

单细胞免疫分析

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单细胞基因表达

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空间蛋白质组学

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单细胞ATAC

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性能

  • 全长配对的TCR/BCR序列
  • 5’全转录组基因表达
  • 靶向基因表达
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 靶向基因表达
  • 多样本混合检测
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 通过开放染色质分析进行表观基因组学研究

扩展应用

  • 细胞表面蛋白
  • 抗原特异性
  • CRISPR筛选
  • 细胞表面蛋白
  • CRISPR筛选
  • 多样本混合检测
  • 免疫荧光蛋白共检测

仪器

  • Chromium X系列单细胞系统
  • Chromium Controller
  • Chromium Connect
Single Cell Gene Expression

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