Chromium Chromium单细胞5’基于条形码的抗原特异性克隆型图谱

在一周时间内全面发现抗原特异性的克隆型

BEAM(基于条形码的抗原特异性克隆型图谱)是一个多重抗原筛选流程,能够快速发现抗原特异性的B细胞(BEAM-Ab)和T细胞(BEAM-T)克隆型。您能够以单细胞分辨率获得全面的抗原特异性细胞图谱,包括全长配对V(D)J序列、基因表达和细胞表面蛋白,并鉴定出稀有的抗原反应性T细胞和B细胞,加速疗法开发。

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Chromium单细胞5’基于条形码的抗原特异性克隆型图谱

Resources:

  • 多重抗原筛选

    流程简化的单次实验,能够筛选数十万个T细胞和B细胞对多达15个抗原的结合特异性。

  • 快速发现

    经过优化的流程可在不到一周的时间内从样本中获得数百个高质量的抗原特异性候选物。

  • 灵活的起始样本

    与多种类型的起始样本兼容,包括PBMC、脾细胞、淋巴结穿刺液以及富集的B细胞或T细胞。

  • 可行的见解

    根据抗原特异性将功能性免疫受体序列与其推定抗原相匹配。

  • 整合的工作流程

    完整的成套解决方案(包括试剂和样本制备指南)可帮助您快速入门。

  • 简化的数据分析

    探索抗原与克隆型的关系,并观察组库多样性和克隆扩增等特征。

快速发现B细胞和T细胞

BEAM-Ab

BEAM-Ab

对数千个B细胞的多重抗原筛选带来最快的候选物生成流程,可改变抗体发现。

  • 从样本到高质量的抗体候选物,仅需一周
  • 对多达15种抗原进行并行筛选,从每个样本中生成数十个至数百个候选物
  • 轻松鉴定理想的候选抗体用于下游验证
BEAM-T

BEAM-T

抗原特异性的T细胞不再难找。现成的简便试剂及前所未有的细胞表征能够将抗原映射到T细胞受体上。

  • 利用成套的定制可加载的MHC单体可在数分钟内制备肽段-MHC复合物
  • 为您带来最大限度的灵活性,可从任何供应商处设计和采购肽段
  • 以单细胞分辨率检测稀有的或与治疗相关的TCR克隆型及基因表达

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BEAM Flyer

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Fast track antigen-specific B- and T-cell discovery

Fast track antigen-specific B- and T-cell discovery

BEAM Product Sheet

BEAM Product Sheet

Multiplexed antigen screening for rapid B- and T-cell clonotype discovery

Multiplexed antigen screening for rapid B- and T-cell clonotype discovery

BEAM Poster

BEAM Poster

arcode Enabled Antigen Mapping (BEAM) enables next-generation systems immunology analysis of the post-COVID-19 immune landscape

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Fast track antigen-specific B- and T-cell discovery

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完整的解决方案

基于Next GEM技术的Chromium仪器

通量灵活、可扩展

Chromium单细胞5’基于条形码的抗原特异性克隆型图谱试剂

利用我们的试剂盒,您能够以单细胞分辨率获得抗原-受体特异性、全长配对的BCR和TCR序列、5’ mRNA以及细胞表面蛋白读数,从而探索功能性的适应性免疫组库。

分析和可视化软件

数据处理平台

数据分析流程

数据可视化软件

世界级的技术支持和客户支持

您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。

工作流程

  1. 1Step 1

    制备样本

    按照样本制备操作指南中的建议,用带有条形码的抗原组装物标记细胞。通过流式分选来富集抗原特异性的细胞群体。与之兼容的细胞悬液包括PBMC、B细胞、T细胞、小鼠脾细胞等样本。

    资源
  2. 2Step 2

    构建10x文库

    采用我们的试剂盒和兼容的Chromium仪器构建带有条形码的10x文库。Chromium仪器家族的每个成员将每个带有10x条形码凝胶珠的细胞封装在单个液滴中。在纳升级的液滴中,细胞经过逆转录生成cDNA,其中单个细胞内的所有cDNA都带有共同的10x条形码。

    资源
  3. 3Step 3

    测序

    上一步生成的带有10x条形码的文库与Illumina测序仪上的标准短读长NGS测序兼容,能够实现数千个单细胞的免疫分析和转录分析。

    资源
  4. 4Step 4

    数据分析

    Cell Ranger可将原始的测序数据转化成有生物学意义的见解。它能够处理基因表达、配对的免疫受体组库序列、细胞表面蛋白和抗原特异性的数据。

    分析流程输出

    输出结果包括质控信息和文件,这些文件可使用Loupe Browser可视化软件或第三方的R工具及Python工具轻松实现进一步分析。

    资源
  5. 5Step 5

    数据可视化

    Loupe V(D)J Browser软件可根据不同的标志物类型来定义和比较细胞类型。

    只有生物信息学家才能使用吗?

    Loupe V(D)J Browser是点选式软件,任何人都可以轻松下载和使用。

    资源

常见问题

可以。BEAM可无缝整合到Chromium单细胞免疫分析流程中,让您能够结合单细胞分辨率的V(D)J测序、基因表达和细胞表面蛋白表达,筛选出推定抗原的BCR/TCR。因此,这项分析能够从抗原特异性的克隆型中获得全长配对的免疫受体序列。

您在BEAM流程中可对每个样本中多达15个抗原进行多重分析。用户提供的抗原需要在生物素化后与带有10x Genomics条形码的BEAM偶联物进行组装。随后可使用这些带有独特条形码的BEAM试剂组装物来标记B细胞和T细胞。

大多数的多聚体分析是基于荧光的,这意味着多聚体分子要连接荧光标记物,才能用于抗原特异性细胞的分选。这类研究可提供细胞群体中抗原特异性细胞的数量。有了BEAM,您不仅能获得这些信息,还能在单细胞水平上获得抗原特异性受体的全长配对V(D)J序列及全转录组基因表达数据。总之,这些数据带来了抗原特异性克隆型的完整细胞图谱,能够带您深入了解免疫应答。

由于抗原特异性的细胞群体很稀少,我们建议在制备10x Genomics文库之前分选出抗原阳性的细胞。不过,分选与否最终取决于您的实验目标。

BEAM提供了空的可加载的即用型MHC I类分子单体试剂盒,适用于以下的人类HLA和小鼠H2k等位基因:

Chromium Human MHC Class I A0201 Monomer Kit

Chromium Human MHC Class I A1101 Monomer Kit

Chromium Human MHC Class I A2402 Monomer Kit

Chromium Human MHC Class I B0702 Monomer Kit

Chromium Mouse MHC Class I H2Kb Monomer Kit

BEAM流程与多种样本类型兼容,包括PBMC、脾细胞、淋巴结穿刺液以及富集的B细胞或T细胞。

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单细胞基因表达

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单细胞多组学ATAC + 基因表达

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Capabilities

  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 多样本混合检测
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 兼容FFPE组织切片和新鲜冷冻组织切片
  • 在同一个单细胞核中进行转录组和开放染色质的联合分析

Extensions

  • 细胞表面蛋白
  • CRISPR筛选
  • 多样本混合检测
  • 免疫荧光蛋白共检测
  • Visium CytAssist Gene and Protein Expression

Instruments

  • Chromium X系列单细胞系统
Single Cell Gene Expression

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