Chromium 单细胞免疫分析

逐个细胞地进行免疫多样性的多组学分析

Chromium单细胞免疫分析为您的免疫学研究提供了一种多组学解决方案。您可以分析配对的全长B细胞或T细胞受体、细胞表面蛋白表达、抗原特异性和基因表达,所有这些信息都来自同一个单细胞。

单细胞免疫分析

Resources:

  • 产品目录
  • 下载产品说明
  • 下载自动化试剂盒产品说明
  • 单细胞购买指南
  • 多组学细胞术

    多组学细胞术

    高灵敏度地检测5'mRNA以及抗原特异性和表型。

  • 完整的免疫组库

    完整的免疫组库

    配对的全长Ig序列(包括同种型)和T细胞受体α/β链。

  • 免疫映射

    免疫映射

    以单细胞分辨率将免疫组库和抗原特异性相结合。

  • 简化的数据分析

    简化的数据分析

    使用易用的软件来探索和查看克隆型信息。

  • 为期一天的实验室流程

    为期一天的实验室流程

    在一天之内完成从样本到可测序文库的过程。

  • 兼容不同的样本

    兼容不同的样本

    经验证适用于PBMC、新鲜和冻存细胞样本,以及解离的组织。

探索您的应用

  • 发现新的细胞类型和功能

  • 全面研究免疫组库

  • 探索抗原特异性

  • 发现新的生物标志物

灵活的解决方案,满足您各种需求

Product Family

Single cell resolution for comprehensive immune profiling

Chromium单细胞免疫分析让您可以通过多组学结果和灵活的通量,探索先天性和适应性免疫系统令人难以置信的多样性。

多组学分析

通过 5' 基因表达同时分析细胞表面蛋白表达和抗原特异性。

免疫组库分析

通过在单细胞水平捕获全长、配对的 B 细胞和 T 细胞受体,了解克隆扩增和多样性。

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Immune Repertoire Profiling
  • 配对受体序列可以更好地鉴定重表达并测试抗原结合及功能
  • 结合基因表达数据,进行免疫细胞分类,发现新的细胞状态
细胞表面蛋白

将基因表达分析与单细胞水平的免疫表型相关联,从而更好地描绘免疫细胞亚群和功能状态。

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Cell Surface Protein
  • 实现超高参数的发现,使用多组学流式细胞术同时检测多达数百种蛋白质,并进行无偏倚的基因表达分析
  • 通过将蛋白质亚型与单细胞中的调节网络共表达相关联来对免疫细胞群体进行分层
抗原特异性

在单细胞分辨率下评估适应性免疫系统的特异性,同时捕获成对的 T 细胞受体和肽-MHC多聚体,或免疫球蛋白重链和轻链及其同源抗原。

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Antigen Specificity
  • 使用条形码肽-MHC多聚体探索公共和个人T 细胞抗原特异性
  • 表征适应性免疫系统如何靶向新抗原
  • 通过更快、更高通量的筛选技术加速抗体发现

大型项目

使用我们的高通量 (HT) 试剂盒和针对大型项目的补充解决方案,处理您最重要的项目,涵盖从稀有细胞类型发现到转化研究。

单细胞免疫分析 HT

在新的 Chromium X上通过高通量 (HT) 多组学分析开展单细胞免疫分析,揭示适应性免疫系统令人难以置信的多样性。

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了解有关 Chromium X的更多信息
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    加快获得结果的时间

    一次分析多达16个样本的单张芯片中的数十万个单细胞。

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    享受规模经济

    利用高通量和靶向基因表达,进一步降低实验和分析成本。

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    从样本制备到分析的全面支持

    从技术资源到用户友好的基于云的数据分析,您都可以获得端到端的全面支持。

Targeted Gene Expression

Profile a defined set of transcripts to reduce costs while increasing sample number or sequencing depth with customizable, comprehensive gene panels.

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    Built to scale

    Maximize sample throughput and reduce hands-on time by multiplexing libraries during target enrichment.

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    Seamless integration

    Don’t miss any data—seamlessly transition between whole transcriptome and targeted analysis from the same library.

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    More for less

    As studies scale, maximize your budget by decreasing sequencing costs with pre-designed or custom targeted panels.

工作流程自动化

使用Chromium Connect的单细胞免疫分析能够最大限度地提高实验室生产效率并获得一致、可重复的结果。

自动化单细胞免疫分析

在Chromium Connect上自动化您的免疫分析工作流程,以更高效地探索T细胞和B细胞组库的多样性,识别稀有细胞群,并揭示克隆扩增在疾病和治疗中的变化。

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    优化生产效率

    缩短您的手动操作时间,从单细胞到可测序的免疫分析文库,方便快捷。

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    标准化您的工作流程

    实现跨实验、跨用户甚至跨多个站点生成一致且可重复的单细胞免疫分析结果。

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    简化操作

    利用预先分装的自动化专用试剂,这些试剂带有颜色编码和2D条形码,可进行试剂的防错跟踪和加载。

经过验证的结果

查看全部

经过验证的结果

视频

观看视频,了解客户如何使用Chromium单细胞免疫分析。

文献

High-Throughput Mapping of B Cell Receptor Sequences to Antigen Specificity

High-Throughput Mapping of B Cell Receptor Sequences to Antigen Specificity

Cell. 2019, Ian Setliff, et al.

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Massively Parallel Single-Cell B-Cell Receptor Sequencing Enables Rapid Discovery of Diverse Antigen-Reactive Antibodies

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Communications Biology. 2019, Leonard D. Goldstein, et al.

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Clonal replacement of tumor-specific T cells following PD-1 blockade

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Nature Medicine. 2019, Katheryn E. Yost, et al.

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A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation

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Science. 2020, Jong-Eun Park, et al.

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资源

查找有关Chromium单细胞免疫分析的最新应用指南及其他文档

A New Way of Exploring Immunity—Linking Highly Multiplexed Antigen Recognition to Immune Repertoire and Phenotype

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Application Note, 10x Genomics

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Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale

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Application Note, 10x Genomics

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Characterization of Tumor Microenvironment

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Application Note, 10x Genomics

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完整的解决方案

基于Next GEM技术的Chromium仪器

基于Next GEM技术的Chromium仪器

小巧灵活

自动化

Chromium单细胞免疫分析试剂

Chromium单细胞免疫分析试剂

利用我们的试剂盒,您可以从多个维度探索适应性免疫力,包括5’ mRNA、配对的全长BCR和TCR序列、抗原-受体特异性、细胞表面蛋白等。

分析和可视化软件

分析和可视化软件

数据分析流程

数据可视化软件

世界级的技术支持和客户支持

世界级的技术支持和客户支持

您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。

工作流程

单细胞免疫分析的基本流程。若您使用我们的Feature Barcoding试剂盒来分析细胞表面蛋白或抗原特异性,我们将会提供其他方案用于修饰您感兴趣的蛋白。

  1. 1Step 1

    样本制备

    从成百上千个细胞开始利用抗体和/或与独特的寡核苷酸条形码偶联的肽段-MHC标记细胞。您可以使用经FACS/MACS分选后的细胞悬液、细针穿刺物、肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)、外周血单核细胞(PBMC)等。

    资源
  2. 2Step 2

    文库构建

    利用我们的试剂盒和Chromium Controller构建带有10x条形码的文库。Chromium Controller将每个带有10x条形码的凝胶珠的细胞封装在单个液滴中。在每个纳升级的液滴中,细胞经过逆转录生成cDNA,其中单个细胞的所有cDNA都带有共同的10x条形码。

    资源
  3. 3Step 3

    测序

    第2步所生成的10x条形码文库与Illumina测序仪上的标准短读长NGS测序兼容,能够实现数千个单细胞的免疫分析和转录分析。

    资源
  4. 4Step 4

    数据分析

    免费下载的Cell Ranger可将原始的测序数据转化成有生物学意义的见解。Cell Ranger可处理重链/轻链测序、基因表达和抗原特异性的数据。

    分析流程输出

    输出结果包括质控信息和文件,这些文件可轻松用于Loupe可视化软件或第三方R工具及Python工具的进一步分析。

    资源
  5. 5Step 5

    数据可视化

    利用我们的Loupe Browser可视化软件,您可以交互式地探索实验结果,并比较不同样本和细胞类型之内或之间的详细克隆型信息,以研究基因使用、组库多样性、克隆扩增等。

    只有生物信息学家才能使用吗?

    Loupe是点选式软件,任何人都可以轻松下载和使用。

    资源

常见问题

该解决方案能够对来自单个细胞的多个类型的数据进行模块化整合,包括基于mRNA的全转录组或靶向基因表达、免疫分型、适应性免疫组库的克隆性和多样性,以及抗原特异性。这种多组学的细胞鉴定方法有助于通过一次实验破译单个细胞的免疫系统规则。

可以。您可以只扩增免疫球蛋白或TCR文库用于测序,而将扩增好的全转录组cDNA样本进行保留,用于后续测序。

Chromium单细胞免疫分析与新鲜或冻存的单细胞悬液兼容。典型的样本包括PBMC、肿瘤浸润淋巴细胞、脾脏、骨髓细胞及其他组织类型。兼容的物种包括人、小鼠、大鼠及其他模式生物。不过,10x Genomics的免疫球蛋白或TCR测序试剂和方案仅支持人和小鼠。

Chromium单细胞免疫分析解决方案利用针对Ig和TCR基因恒定区的基因特异性扩增引物来富集和测序整个V(D)J基因片段。

可以,免疫球蛋白的重链序列可分为IgA、IgD、IgE、IgM和IgG。

相关产品

产品

单细胞免疫分析

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单细胞基因表达

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空间基因表达

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单细胞ATAC

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性能
  • 全长配对的TCR/BCR序列
  • 5’全转录组基因表达
  • 靶向基因表达
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 靶向基因表达
  • 多样本混合检测
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 靶向基因表达
  • 兼容FFPE组织切片和新鲜冷冻组织切片
  • 通过开放染色质分析进行表观基因组学研究
扩展应用
  • Cell Surface Protein
  • Antigen Specificity
  • Cell Surface Protein
  • CRISPR筛选
  • 多样本混合检测
  • Spatial Gene Expression with Immunofluorescence
  • 免疫荧光蛋白共检测
仪器
  • Chromium X系列单细胞系统
  • Chromium Controller
  • Chromium Connect
  • Chromium X系列单细胞系统
  • Chromium Controller
  • Chromium Connect
  • Chromium X系列单细胞系统
  • Chromium Controller
Single Cell Gene Expression

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