单细胞分辨率的染色质开放性研究

Chromium单细胞ATAC(染色质转座酶可接近性分析)解决方案

利用单细胞表观基因组学逐个细胞地揭示染色质开放性

Chromium单细胞ATAC(染色质转座酶可接近性分析)解决方案可加速对基因组调控景观的深入了解,从而提供细胞变化的内在信息。通过数万个单细胞的染色质图谱分析,研究人员能够以高分辨率观察到染色质压缩和DNA结合蛋白如何调控基因表达。

Chromium单细胞ATAC解决方案还包含直观的分析软件和可视化工具,能够对单细胞的基因调控网络进行精细的分析。Chromium单细胞ATAC解决方案还可以用于开展发育可塑性、细胞异质性等研究。

  • 探索由表观遗传变化引起的细胞异质性
  • 更好地了解基因表达上游的基因调控网络
  • 定义细胞类型和状态从而用于谱系和发育追踪
  • 加速生物标志物的开发

该解决方案的特点

  • 通过转录起始位点(TSS)和调控区域的密集信号来检测单细胞中的开放染色质区域
  • 利用可扩展的高通量解决方案,每个通道可分析500至10,000个细胞
  • 上样到芯片上的细胞核回收率高达65%
  • 可用于研究细胞系、原代细胞、新鲜样品和冻存样品
  • 利用一体化分析软件和交互式可视化工具分析单细胞表观遗传数据
  • 可使用Next GEM技术
查看工作流程
Single Cell ATAC Solution

单细胞ATAC-seq

观看工作原理

通过并行分析数万个细胞核,获得全基因组范围内的染色质开放信息。利用转座酶将接头优先插入开放的DNA片段进行标记,并在一天之内制备好测序文库,从而鉴定开放的染色质区域。测序完成后,利用我们简单易用的软件来分析和查看高分辨率的表观遗传数据。

Chromium Controller

小巧,时尚,高效。

小巧而时尚的Chromium Controller快速有效地结合了大量分区数量和大量不同的条形码库,能够在几分钟内高效地自动化生成大于10万个含有条形码的分区,从而实现高度并行的样品分液和添加分子标签。在Chromium Controller上,用户可以运行任何Chromium解决方案——从基因组到单细胞分析

了解Chromium Controller
Single Cell Controller

产品列表

Chromium单细胞ATAC解决方案

Single Cell ATAC Version

试剂和耗材

反应
产品代码
Chromium Chip E Single Cell ATAC Kit
1000086
1000082
Chromium i7 Multiplex Kit N, Set A
96 rxns
1000084
Chromium Next GEM Chip H Single Cell Kit
1000162
1000161
Chromium Next GEM Single Cell ATAC Library & Gel Bead Kit v1.1
1000176
1000175
Chromium Single Cell ATAC Library & Gel Bead Kit
1000111
1000110

仪器

保修期
产品代码
Chromium Controller & Next GEM Accessory Kit
120223
120246
Chromium Controller & Next GEM Accessory Kit
1000202
1000204

软件

Cell Ranger ATAC
Loupe Cell Browser

文档

Chromium Single Cell ATAC Reagent Kits User Guide (v1.1 Chemistry)

*Multiplex Kit that is compatible with the Chromium Single Cell ATAC Solution

单细胞ATAC数据集
海报墙

High throughput immune profiling using integrated single cell multi-omics analyses

  • Single Cell Biology Keystone Symposia
    Breckenridge, CO
    January 2019

Single cell ATAC-seq for characterization of complex biological systems

  • Single Cell Biology Keystone Symposia
    Breckenridge, CO
    January 2019

Single cell ATAC-seq for characterization of complex biological systems

  • Human Cell Atlas Conference
    Cambridge, MA
    November 2018

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