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成功するためのヒントとコツ:シングルセル遺伝子発現実験サンプル調製法

成功するためのヒントとコツ:シングルセル遺伝子発現実験サンプル調製法

シングルセルトランスクリプトミクス技術は、細胞ひとつひとつの遺伝子発現 ダイナミクスを調べることで、複雑な生体内システムを解明する強力なツール です。細胞集団からシングルセルプロファイルを作成するシングルセル RNA シーケンス(scRNA-seq)を行うと、複数の細胞種から構成されるサンプルの細 胞種特異的な差異を発見することができるのです。さらにシングルセル遺伝子 発現プロファイリングからは、疾患が発症および進行している細胞内のプロセ スをはっきりと理解することができます。技術的に進歩した scRNA-seq によっ て、一般的なバルク RNA-seq 法では見落としてしまうことが多い、希少な細胞 種や新規な細胞種などのデータを入手するができ、遺伝子発現の真の多様性を 探索することが可能です(図 1)。しかし、この革新的な技術の利点を最大限に 活用するには、シングルセルサンプルを適切に調製することが不可欠です。こ の資料では、10x Genomics のシングルセル遺伝子発現ソリューションまたは 免疫プロファイリングソリューションで推奨するシングルセルサンプルの最適 な調製方法について解説します。

シングルセルトランスクリプトミクス技術は、細胞ひとつひとつの遺伝子発現 ダイナミクスを調べることで、複雑な生体内システムを解明する強力なツール です。細胞集団からシングルセルプロファイルを作成するシングルセル RNA シーケンス(scRNA-seq)を行うと、複数の細胞種から構成されるサンプルの細 胞種特異的な差異を発見することができるのです。さらにシングルセル遺伝子 発現プロファイリングからは、疾患が発症および進行している細胞内のプロセ スをはっきりと理解することができます。技術的に進歩した scRNA-seq によっ て、一般的なバルク RNA-seq 法では見落としてしまうことが多い、希少な細胞 種や新規な細胞種などのデータを入手するができ、遺伝子発現の真の多様性を 探索することが可能です(図 1)。しかし、この革新的な技術の利点を最大限に 活用するには、シングルセルサンプルを適切に調製することが不可欠です。こ の資料では、10x Genomics のシングルセル遺伝子発現ソリューションまたは 免疫プロファイリングソリューションで推奨するシングルセルサンプルの最適 な調製方法について解説します。